R语言 topGO包 Gene set tests statistics()函数中文帮助文档(中英文对照)

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Gene set tests statistics(topGO)
Gene set tests statistics()所属R语言包：topGO

                                        Gene set tests statistics
                                         基因组测试统计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Methods which implement and run a group test statistic for a class inheriting from groupStats class. See Details section for a description of each method.
实施和运行一个从groupStats类的继承的类组试验统计的方法。每个方法的说明，请参阅详细信息部分。


用法----------Usage----------


GOFisherTest(object)
GOKSTest(object)
GOtTest(object)
GOglobalTest(object)
GOSumTest(object)
GOKSTiesTest(object)



参数----------Arguments----------

参数：object
An object of class groupStats or decedent class.
类groupStats或继承人类的对象。


Details

详情----------Details----------

GOFisherTest: implements Fischer's exact test (based on contingency table) for groupStats objects dealing with "counts".
GOFisherTest：实现菲舍尔的精确检验（根据应急表）groupStats处理“罪状”的对象。

GOKSTest: implements the Kolmogorov-Smirnov test for groupStats objects dealing with gene "scores". This test uses the ks.test function and does not implement the running-sum-statistic test based on permutations.
GOKSTest：实现groupStats处理基因“分数”对象的Kolmogorov-Smirnov检验。本试验采用ks.test功能并没有实现运行和统计检验的基础上的排列。

GOtTest: implements the t-test for groupStats objects dealing with gene "scores". It should be used when the gene scores are t-statistics or any other score following a normal distribution.
GOtTest：实现groupStats对象处理基因“分数”的t-检验。它应该被用来基因的分数时，t-统计或任何其他的得分正态分布。

GOglobalTest: implement Goeman's globaltest.
GOglobalTest：实施Goeman的globaltest。


值----------Value----------

All these methods return the p-value computed by the respective test statistic.
所有这些方法都返回各自的测试统计计算p值。


作者（S）----------Author(s)----------


Adrian Alexa



参见----------See Also----------

groupStats-class, getSigGroups-methods
groupStats-class，getSigGroups-methods

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注：
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