R语言 tilingArray包 PMindex()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

PMindex(tilingArray)
PMindex()所属R语言包：tilingArray

                                        Find the index of the exact match (PM) or background probes from a probeAnno environment
                                         找到完全匹配（下午）或背景探测从probeAnno环境指数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Find the index of the exact match (PM) or background probes from a probeAnno environment
找到完全匹配（下午）或背景探测从probeAnno环境指数


用法----------Usage----------


PMindex(probeAnno)
BGindex(probeAnno)



参数----------Arguments----------

参数：probeAnno
environment with probe annotations. See package davidTiling for an example (?probeAnno).
环境探针注释。见例如（probeAnno）davidTiling包。


Details

详情----------Details----------

These functions extract the exact match probes (PM) or background probes (from intergenic regions outside of known annotations) indices from probeAnno.   These indices can be used to select the relevant rows of intensity data from the ExpressionSet object for plotting and normalization.
这些功能从probeAnno提取完全匹配的探针（下午）或背景探测器（从已知的注解外的间隔区）指数。这些指标可以用来选择强度数据从相关行ExpressionSet策划和标准化的对象。


值----------Value----------

Numeric vector of indices.
数字矢量指数。


作者（S）----------Author(s)----------


Matt Ritchie <ritchie@ebi.ac.uk>



举例----------Examples----------


## library(davidTiling)[＃库（davidTiling）]
## data(davidTiling)[＃数据（davidTiling的）]
## data(probeAnno)[＃数据（probeAnno的）]
## pmind &lt;- PMindex(probeAnno)[＃pmind < -  PMindex（probeAnno的）]
## mmind &lt;- MMindex(probeAnno)[＃mmind < -  MMindex（probeAnno的）]
## bgind &lt;- BGindex(probeAnno)[＃bgind < -  BGindex（probeAnno的）]
## boxplot(as.data.frame(log2(exprs(davidTiling))[pmind,]), outline=FALSE)           [＃盒形图（as.data.frame（为log2（exprs（davidTiling））[pmind，]），外形为FALSE）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。