R语言 sva包 f.pvalue()函数中文帮助文档(中英文对照)

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f.pvalue(sva)
f.pvalue()所属R语言包：sva

                                        Quickly calculate F-test p-values
                                         快速计算F检验的p值

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculate p-values from a parametric F-test comparing the models mod and mod0 for each row of the data set dat.
计算从一个参数比较模型国防部和每一行的数据集DAT MOD0 F检验的p值。


用法----------Usage----------


  f.pvalue(dat,mod,mod0)



参数----------Arguments----------

参数：dat
A m genes by n arrays matrix of expression data
由n阵列基因表达数据矩阵A M基因


参数：mod
A n by k model matrix corresponding to the primary model fit    (see model.matrix)
K型矩阵对应的主模型拟合A N（见model.matrix）的


参数：mod0
A n by k0 model matrix corresponding to the null model  to be compared to  mod.
一个n到K0模型矩阵对应的空模型进行比较，以国防部。


Details

详情----------Details----------

The data for test i should be in the ith row of dat, if mod0 is null, the first column of mod is used as the null model.
我应该是在第i行的DAT，如果MOD0是空的测试数据，国防部第一列作为空模型。


值----------Value----------


参数：p
A vector of p-values one for each row of dat.
一个向量p值每个DAT行之一。


作者（S）----------Author(s)----------


Jeffrey T. Leek <a href="mailto:jleek@jhsph.edu">jleek@jhsph.edu</a>, John Storey <a href="mailto:jstorey@princeton.edu">jstorey@princeton.edu</a>



举例----------Examples----------


  ## Not run: [＃无法运行：]
  ## Load data[＃将数据]
  library(bladderbatch)
  data(bladderdata)
  
  ## Obtain phenotypic data[＃获取表型数据。]
  pheno = pData(bladderEset)
  edata = exprs(bladderEset)
  batch = pheno$batch
  mod = model.matrix(~as.factor(cancer), data=pheno)
  mod0 = model.matrix(~1, data=pheno)
  
  #Calculate the p-values[计算p值]
  p <- f.pvalue(edat,mod,mod0)
  hist(p)
  

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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