tdrocc(survcomp)
tdrocc()所属R语言包:survcomp
Function to compute time-dependent ROC curves
函数来计算时间依赖的ROC曲线
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function is a wrapper for the survivalROC function in order to compute the time-dependent ROC curves.
该函数是survivalROC函数的包装,以计算时间依赖的ROC曲线。
用法----------Usage----------
tdrocc(x, surv.time, surv.event, surv.entry = NULL, time, cutpts = NA,
na.rm = FALSE, verbose = FALSE, span = 0, lambda = 0, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
vector of risk scores.
向量的风险评分。
参数:surv.time
vector of times to event occurrence.
事件发生时间的向量。
参数:surv.event
vector of event occurrence indicators.
事件发生指标的向量。
参数:surv.entry
entry time for the subjects.
为主题的入境时间。
参数:time
time point for the ROC curve.
ROC曲线的时间点。
参数:cutpts
cut points for the risk score.
风险评分为切点。
参数:na.rm
TRUE if the missing values should be removed from the data, FALSE otherwise.
TRUE如果缺失值应当从数据中删除,FALSE否则。
参数:verbose
verbosity of the function.
冗长的函数。
参数:span
Span for the NNE, need either lambda or span for NNE.
为北北东向的跨度,需要或者拉姆达东北偏北或跨度。
参数:lambda
smoothing parameter for NNE.
为北北东向的平滑参数。
参数:...
additional arguments to be passed to the survivalROC function.
额外的参数将被传递给survivalROC功能。
值----------Value----------
参数:spec
specificity estimates
特异性估计
参数:sens
sensitivity estimates
灵敏度估计
参数:rule
rule to compute the predictions at each cutoff
裁定的预测计算每个截止
参数:cuts
cutoffs
截止
参数:time
time point at which the time-dependent ROC is computed
在计算时间依赖的中华民国的时间点
参数:survival
overall survival at the time point
在时间点的整体生存
参数:AUC
Area Under the Curve (AUC) of teh time-dependent ROC curve
德随时间变化的曲线的曲线下面积(AUC为)
参数:data
survival data and risk score used to compute the time-dependent ROC curve
生存数据和风险得分用于计算随时间变化的曲线
作者(S)----------Author(s)----------
Benjamin Haibe-Kains
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
set.seed(12345)
age <- rnorm(100, 50, 10)
stime <- rexp(100)
cens <- runif(100,.5,2)
sevent <- as.numeric(stime <= cens)
stime <- pmin(stime, cens)
tdroc <- tdrocc(x=age, surv.time=stime, surv.event=sevent, time=1,
na.rm=TRUE, verbose=FALSE)
##plot the time-dependent ROC curve[#绘制随时间变化的曲线。]
plot(x=1-tdroc$spec, y=tdroc$sens, type="l", xlab="1 - specificity",
ylab="sensitivity", xlim=c(0, 1), ylim=c(0, 1))
lines(x=c(0,1), y=c(0,1), lty=3, col="red")
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