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nki7g(survcomp)
nki7g()所属R语言包：survcomp

                                        Subset of NKI dataset containing gene expression, annotations and clinical data.
                                         NKI日经指数数据集的子集包含的基因表达，注释和临床资料。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This dataset contains a subset of the gene expression, annotations and clinical data from the NKI datasets (see section details). The subset contains the seven genes introduced by Desmedt et al. 2008
该数据集包含的基因表达，注释和临床数据从NKI日经指数数据集（见部分详细介绍）的一个子集。该子集包含的七个基因引入由Desmedt等。 2008


格式----------Format----------

ExpressionSet with 7 features and 337 samples, containing:
ExpressionSet 7功能和337样品，包含：

exprs(nki7g): Matrix containing gene expressions as measured by Agilent technology (dual-channel, oligonucleotides).
exprs(nki7g)：矩阵由安捷伦科技（双通道，寡核苷酸）的基因表达。

fData(nki7g): AnnotatedDataFrame containing annotations of Agilent microarray platform.
fData(nki7g)：AnnotatedDataFrame的安捷伦芯片平台的注解。

pData(nki7g): AnnotatedDataFrame containing Clinical information of the breast cancer patients whose tumors were hybridized.
pData(nki7g)：AnnotatedDataFrame包含的杂交瘤，乳腺癌患者的临床资料。

experimentalData(nki7g): MIAME object containing information about the dataset.
experimentalData(nki7g)：，MIAME对象，其中包含有关数据集的信息。

annotation(nki7g): Name of the agilent chip.
annotation(nki7g)：安捷伦芯片的名称。


Details

详情----------Details----------

This dataset represents a subset of the study published by van't Veer et al. 2002 and van de Vijver et al. 2002. The subset contains the genes AURKA (also known as STK6, STK7, or STK15), PLAU (also known as UPA), STAT1, VEGF, CASP3, ESR1, and ERBB2, as introduced by Desmedt et al. 2008. The seven genes represent the proliferation, tumor invasion/metastasis, immune response, angiogenesis, apoptosis phenotypes, and the ER and HER2 signaling, respectively.
本集代表范特韦埃尔等发表的这项研究的一个子集。 2002年和面包车•维杰威等人。 2002年。该子集包含AURKA（又称STK6，STK7或STK15基因）的基因，普劳（也称为通用电力线联盟），STAT1和血管内皮生长因子，CASP3，ESR1，和ErbB2，由Desmedt等介绍。 2008年。 7个基因的增殖，肿瘤浸润/转移，免疫反应，血管新生，单元凋亡的表型，ER和HER2发信号，分别。


源----------Source----------

nki:
NKI：

http://www.rii.com/publications/2002/vantveer.html



参考文献----------References----------




举例----------Examples----------


## load Biobase package[＃加载BIOBASE包。]
library(Biobase)
## load the dataset[＃加载数据集]
data(breastCancerData)
## show the first 5 columns of the expression data[＃显示表达数据的第5列]
exprs(nki7g)[ ,1:5]
## show the first 6 rows of the phenotype data[＃显示的第6行的表型数据]
head(pData(nki7g))
## show first 20 feature names[＃显示前20个功能名称]
featureNames(nki7g)
## show the experiment data summary[＃显示的实验数据汇总]
experimentData(nki7g)
## show the used platform[＃显示所使用的平台。]
annotation(nki7g)
## show the abstract for this dataset[＃显示该数据集的抽象。]
abstract(nki7g)

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