logpl(survcomp)
logpl()所属R语言包:survcomp
Function to compute the log partial likelihood of a Cox model
函数来计算的Cox模型的局部可能性log
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function computes the log partial likelihood of a set of coefficients given some survival data.
函数计算的log部分的可能性,给予一定的生存数据的一组系数。
用法----------Usage----------
logpl(pred, surv.time, surv.event, strata, na.rm = FALSE, verbose = FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:surv.time
vector of times to event occurrence
次事件发生的矢量
参数:surv.event
vector of indicators for event occurrence
事件发生的指标向量
参数:pred
linear predictors computed using the Cox model
使用Cox模型计算线性预测
参数:strata
stratification variable
分层变量
参数:na.rm
TRUE if the missing values should be removed from the data, FALSE otherwise
TRUE如果缺失值应当从数据中删除,FALSE否则
参数:verbose
verbosity of the function
冗长的函数
值----------Value----------
vector of two elements: logpl and event for the estimation of the log partial likelihood and the number of events, respectively
矢量两部分组成:logpl和event的log部分的可能性的估计和事件的数量,分别
作者(S)----------Author(s)----------
Benjamin Haibe-Kains
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
require(survival)
set.seed(12345)
age <- rnorm(100, 50, 10)
stime <- rexp(100)
cens <- runif(100,.5,2)
sevent <- as.numeric(stime <= cens)
stime <- pmin(stime, cens)
dd <- data.frame("stime"=stime, "sevent"=sevent, "age"=age)
##Cox model[#Cox模型]
coxm <- coxph(Surv(stime, sevent) ~ age, data=dd)
##log partial likelihood of the null model[#登录空模型的局部可能性。]
logpl(pred=rep(0, nrow(dd)), surv.time=stime, surv.event=sevent)
##log partial likelihood of the Cox model[#登录Cox模型的局部可能性。]
logpl(pred=predict(object=coxm, newdata=dd), surv.time=stime, surv.event=sevent)
##equivalent to[#相当于]
coxm$loglik
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