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R语言 survcomp包 km.coxph.plot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 15:19:20 | 显示全部楼层 |阅读模式
km.coxph.plot(survcomp)
km.coxph.plot()所属R语言包:survcomp

                                        Function to plot several Kaplan-Meier survival curves
                                         函数进行绘图几个Kaplan-Meier生存曲线

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to plot several Kaplan-Meier survival curves with number of individuals at risk at some time points.
函数进行绘图与个人风险在某些时间点几个Kaplan-Meier生存曲线。


用法----------Usage----------


km.coxph.plot(formula.s, data.s, sub.s = "all", x.label, y.label,
  main.title, sub.title, leg.text, leg.pos = "bottomright", leg.inset = 0.05,
  o.text, v.line, h.line, .col = 1:4, .lty = 1, .lwd = 1, show.n.risk = FALSE,
  n.risk.step, n.risk.cex = 0.85, verbose = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数:formula.s
formula composed of a Surv object and a strata variable (i.e. stratification).
Surv对象和阶层变量(即分层)组成的配方。


参数:data.s
data frame composed of the variables used in the formula.
在公式中使用的变量组成的数据框。


参数:sub.s
vector of booleans specifying if only a subset of the data should be considered. Default value is "all".
如果只有一个数据子集,应考虑指定布尔值的向量。默认值是“所有”。


参数:x.label
label for the y-axis.
为y轴的标签。


参数:y.label
label for the x-axis.
为x轴的标签。


参数:main.title
main title at the top of the plot.
图顶部的主标题。


参数:sub.title
subtitle at the bottom of the plot.
字幕在底部的图。


参数:leg.text
text in the legend.
传说中的文本。


参数:leg.pos
the location may also be specified by setting 'x' to a single keyword from the list "bottomright", "bottom", "bottomleft", "left", "topleft", "top", "topright", "right" and "center". This places the legend on the inside of the plot frame at the given location.
位置也可以指定从列表中设置一个关键字X"bottomright","bottom","bottomleft","left","topleft","top","topright","right"和"center"。这对传说的图框架内,在指定位置。


参数:leg.inset
inset distance from the margins as a fraction of the plot region. Default value is 0.05.
图区域的一小部分的利润作为插图距离。默认值是0.05。


参数:o.text
plot the logrank p-value.
绘制数秩p值。


参数:v.line
x coordinate(s) for vertical line(s).
x坐标的垂直线(S)(S)。


参数:h.line
y coordinate(s) for horizontal line(s).
y坐标水平线(S)(S)。


参数:.col
vector of colors for the different survival curves.
向量的不同的生存曲线的颜色。


参数:.lty
vector of line types for the different survival curves
不同的生存曲线类型的向量


参数:.lwd
vector of line widths for the different survival curves.
向量的不同的生存曲线的线宽。


参数:show.n.risk
if TRUE, show the numbers of samples at risk for each time step.
如果TRUE,显示风险,为每一个时间步样品的数量。


参数:n.risk.step
vector specifying the time to be the steps for displaying the number of individuals at risk.
向量指定的时间显示在个人风险的步骤。


参数:n.risk.cex
size of the number of individuals at risk. Default value is 0.85.
个人风险的大小。默认值是0.85。


参数:verbose
verbosity level (TRUE or FALSE). Default value is TRUE.
冗赘级别(TRUE或FALSE)。默认值是TRUE。


参数:...
additional parameters to be passed to the plot function.
额外的参数将被传递给plot功能。


Details

详情----------Details----------

The original version of this function was kindly provided by Dr Christos Hatzis (January, 17th 2006).
议员克里斯托Hatzis(1月17日2006年),请提供此功能的原始版本。


作者(S)----------Author(s)----------


Christos Hatzis, Benjamin Haibe-Kains



参见----------See Also----------

survfit, coxph
survfit,coxph


举例----------Examples----------


set.seed(12345)
stime <- rexp(100) * 10
cens   <- runif(100,.5,2) * 10
sevent  <- as.numeric(stime <= cens)
stime <- pmin(stime, cens)
strat <- sample(1:3, 100, replace=TRUE)
dd <- data.frame("surv.time"=stime, "surv.event"=sevent, "strat"=strat)

km.coxph.plot(formula.s=Surv(surv.time, surv.event) ~ strat, data.s=dd,
  sub.s="all", x.label="Time (years)", y.label="Probability of survival",
  main.title="", leg.text=paste(c("Low", "Intermediate", "High"), "   ", sep=""),
  leg.pos="topright", leg.inset=0, .col=c("darkblue", "darkgreen", "darkred"),
  .lty=c(1,1,1), show.n.risk=TRUE, n.risk.step=2, n.risk.cex=0.85, verbose=FALSE)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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