cindex.comp.meta(survcomp)
cindex.comp.meta()所属R语言包:survcomp
Function to compare two concordance indices
函数来比较两个一致性指数
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function compares two lists of concordance indices computed from the same survival data by using the function concordance.index. The statistical test is a Student t test for dependent samples.
这个函数比较两个相同的生存数据计算一致性指标,通过使用功能concordance.index名单。统计检验是相依样本t检验。
用法----------Usage----------
cindex.comp.meta(list.cindex1, list.cindex2, hetero = FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:list.cindex1
first list of concordance indices as returned by the concordance.index function.
concordance.index函数返回的一致性指数的第一个列表。
参数:list.cindex2
second list of concordance indices as returned by the concordance.index function.
concordance.index函数返回的一致性指数的第二个列表。
参数:hetero
if TRUE, a random effect model is use to compute the meta-estimators. Otherwise a fixed effect model is used.
如果为TRUE,使用随机效应模型计算元估计。否则,使用固定效应模型。
Details
详情----------Details----------
In meta-analysis, we estimate the statistic of interest in several independent datasets. It results a list of estimates such as list of concordance indices. The two lists of concordance indices must be computed from the same samples (and corresponding survival data). The function computes a meta-estimator for the correlations between the two scores and uses a Student t test for dependent samples.
在荟萃分析中,我们估计统计的几个独立的数据集的兴趣。它的结果估计,如一致性指数列表列表。必须从同一样品(以及相应的生存数据)计算一致性指数两个列表。函数计算两个分数之间的相关性的Meta估计,使用相依样本学生t检验。
值----------Value----------
参数:p.value
p-value from the Student t test for the comparison cindex1 > cindex2.
从的比较cindex1> cindex2的学生t检验的p值。
参数:cindex1
meta-estimator of the first concordance index.
元第一一致性指数的估计。
参数:cindex2
meta-estimator of the second concordance index.
元的第二个一致性指数的估计。
作者(S)----------Author(s)----------
Benjamin Haibe-Kains
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
#first dataset[第一个数据集]
set.seed(12345)
age <- rnorm(100, 50, 10)
size <- rexp(100,1)
stime <- rexp(100)
cens <- runif(100,.5,2)
sevent <- as.numeric(stime <= cens)
stime <- pmin(stime, cens)
c1.1 <- concordance.index(x=age, surv.time=stime, surv.event=sevent,
method="noether")
c2.1 <- concordance.index(x=size, surv.time=stime, surv.event=sevent,
method="noether")
#second dataset[第二个数据集]
set.seed(54321)
age <- rnorm(110, 53, 10)
size <- rexp(110,1.1)
stime <- rexp(110)
cens <- runif(110,.55,2)
sevent <- as.numeric(stime <= cens)
stime <- pmin(stime, cens)
c1.2 <- concordance.index(x=age, surv.time=stime, surv.event=sevent,
method="noether")
c2.2 <- concordance.index(x=size, surv.time=stime, surv.event=sevent,
method="noether")
cindex.comp.meta(list.cindex1=list("cindex.age1"=c1.1, "cindex.age2"=c1.2),
list.cindex2=list("cindex.size1"=c2.1, "cindex.size2"=c2.2))
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