R语言 stepNorm包 maCompPlate2()函数中文帮助文档(中英文对照)

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maCompPlate2(stepNorm)
maCompPlate2()所属R语言包：stepNorm

                                        Generate plate IDs
                                         生成板的ID

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function is a modification of the maCompPlate function in the marray library. It generates plate IDs from the dimensions of the grid and spot matrices. Unlike the maCompPlate function, the number of spots is not necessarily a multiple of the number of wells on a plate, therefore this function allows empty spots on the slide.
这个函数是一个maCompPlate函数marray库的修改。它生成网格和点矩阵板的尺寸标识。 maCompPlate函数不同，斑点的数量不一定是一个盘子上井数量多，因此，此功能允许在幻灯片上的空白点。


用法----------Usage----------


maCompPlate2(no.plates = NULL, n = 384)



参数----------Arguments----------

参数：no.plates
object of class "numeric", number of plates used specified by the user. If a number is not specified, then it is assumed that there are no empty spots on the slide.
对象类的“数字”，由用户指定的用于板。如果未指定数量，那么它假定，在幻灯片上有没有空点。


参数：n
object of class "numeric", number of wells in each plate, usually 384 or 96.
对象类的“数字”，井数，每块板，通常是384或96。


Details

详情----------Details----------

This function can be used to handle three cases: 1) the number of spots is a multiple of the number of wells on a plate (usually 96 or 384); 2) the number of spots is not a multiple of the number of wells on a plate, and several of spots on the slide are therefore left empty. In this case, the user needs to specify the number of total plates used; plate IDs of empty spots will be NAs; 3)the number of spots is not a multiple of the number of wells on a plate, but all spots on the slide are spotted, therefore there is one plate not fully used. In this case, the user does not need to specify the number of total plates (as this will not be an integer), the function assumes no empty spots on the slide automatically. See Examples below.  
此功能可用于处理三起情况：1）斑点的数量是一盘多井数（通常是96或384）; 2）斑点的数量是没有井数的倍数一个盘子，和几个在幻灯片上的斑点，因此空。在这种情况下，用户需要指定使用的总盘子的数量;空点的板ID将NAS; 3）斑点的数量是不是在一个盘子多个井的数量，但在幻灯片上的所有点被发现，因此有一盘没有充分利用。在这种情况下，用户不需要指定板总数（因为这会不会是一个整数），函数假定自动幻灯片上没有空点。见下面的例子。


值----------Value----------

The function maCompPlate2 returns a function with bindings for no.plates and n, which when receiving a object of  marrayRaw, marrayNorm or marrayLayout class, it returns a vector of plate IDs (factor).
函数maCompPlate2no.plates和n，接收的对象时，marrayRaw，marrayNorm或marrayLayout类，函数返回绑定它返回一个板块的ID（factor）的向量。


作者（S）----------Author(s)----------


Yuanyuan Xiao



参见----------See Also----------

maCompPlate, marrayLayout.
maCompPlate，marrayLayout。


举例----------Examples----------


####### case 1: no empty spots on the slide, full plates used[＃＃＃＃＃＃例1：幻灯片上没有空点，全板使用]
L<-new("marrayLayout", maNgr=4, maNgc=4, maNsr=22, maNsc=24)
### "compPlate" is a function[＃＃“compPlate”是一个功能]
compPlate <- maCompPlate2(n=384)
plate <- compPlate(L)
table(plate)
### can also use:[＃＃也可以使用：]
plate<-maCompPlate(L,384)
table(plate)

####### case 2: with empty spots on the slide, full plates used[＃＃＃＃＃＃例2：用幻灯片上的空白点，全板使用]
L<-new("marrayLayout", maNgr=4, maNgc=4, maNsr=22, maNsc=26)
### "compPlate" is a function[＃＃“compPlate”是一个功能]
compPlate <- maCompPlate2(no.plates=22,n=384)
plate <- compPlate(L)
table(plate)
### empty spots are NAs[＃空点是定居]
unique(plate)

###### case 3: no empty spots on the slide, one plate not full[＃＃＃＃＃案例3：在幻灯片上没有空点，一盘不充分]
L<-new("marrayLayout", maNgr=4, maNgc=4, maNsr=22, maNsc=26)
### argument no.plates not specified, the function assumes no empty spots[＃＃参数no.plates没有指定，该函数不承担任何空点]
compPlate <- maCompPlate2(n=384)
plate <- compPlate(L)
### 23 full plates (384), the 24th not full (304)[＃23全板（384），24日的不完整（304）]
table(plate)
### no NAs, no empty spots[＃没有NAS，没有空点]
unique(plate)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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