plotPosBias(Starr)
plotPosBias()所属R语言包:Starr
Bias of hybridzation, depending on base position in sequence.
偏见杂交,根据碱基序列中的位置。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
plotPosBias generates a plot showing the bias of hybridzation, depending on base position in sequence.
plotPosBias杂交偏见,取决于基序列中的位置生成一个图。
用法----------Usage----------
plotPosBias(intensity, sequence, main="", ylim)
参数----------Arguments----------
参数: intensity
a vector of type numeric, containing the measured intensities
一种类型的数字向量,测得的强度
参数: sequence
a vector of type character, containing the sequneces
向量的类型字符,包含sequneces
参数: main
head of the plot
图头
参数:ylim
ylim of plot
ylim积
作者(S)----------Author(s)----------
Benedikt Zacher <a href="mailto:zacher@lmb.uni-muenchen.de">zacher@lmb.uni-muenchen.de</a>
举例----------Examples----------
##[#]
sequence <- unlist(lapply(1:50000, function(x) {paste(sample(c("A","T","C","G"),prob=c(0.3,0.3,0.2,0.2),25,replace=TRUE), collapse="")}))
values <- runif(50000,min=-2,max=2)
plotPosBias(values, sequence)
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注:
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