bpmapToProbeAnno(Starr)
bpmapToProbeAnno()所属R语言包:Starr
Creating a probeAnno object
创建probeAnno对象
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function allows the user to create a probeAnno environment that holds the mapping between
此功能允许用户创建一个probeAnno持有之间的映射环境
用法----------Usage----------
bpmapToProbeAnno(bpmap, verbose=T, uniqueSeq=T)
参数----------Arguments----------
参数: bpmap
Either a list, created by the function readBpmap() from the affy package. Or a path to the bpmap file.
无论是列表,创建功能readBpmap(从affy包)。或路径的bpmap文件。
参数:verbose
should the progress be printed out?
应该被打印出来的进展?
参数:uniqueSeq
If TRUE, probes sequences that occur more than once on the chip (and consequently match several positions on the genome) are set to 1 in the probeAnno object. Unique probes are set to 0. If false, all probes are set to 0. To identify all unique and multiple matching probes, a remapping of the probes to the genome is recommended.
如果是TRUE,探针序列发生不止一次芯片上(因此匹配的基因组上的几个位置)设置为1在probeAnno对象。独特的探针设置为0。如果为false,所有探针都设置为0。找出所有独特和多个匹配探针,探针重新映射到基因组的建议。
作者(S)----------Author(s)----------
Benedikt Zacher <a href="mailto:zacher@lmb.uni-muenchen.de">zacher@lmb.uni-muenchen.de</a>
举例----------Examples----------
##[#]
# dataPath <- system.file("extdata", package="Starr")[< - 。系统数据通路(的“extdata”,包=“斯塔尔”)]
# bpmapChr1 <- readBpmap(file.path(dataPath, "Scerevisiae_tlg_chr1.bpmap"))[bpmapChr1 < - readBpmap(file.path(数据通路,“Scerevisiae_tlg_chr1.bpmap”))]
# probeAnnoChr1 <- bpmapToProbeAnno(bpmapChr1)[probeAnnoChr1 < - bpmapToProbeAnno(bpmapChr1的)]
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|