hist(SSPA)
hist()所属R语言包:SSPA
Histogram of p-values of the pilot data
试验数据的P-值的直方图
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function hist computes a histogram of p-values of the given pilot data. Two-sided p-values are computed either using the normal or Student t distribution based on the test statistics that are stored in an object of PilotData.
的功能histp值给定的试验数据计算直方图。双面的P-值计算使用存储在对象PilotData正常或学生t分布,根据测试统计。
用法----------Usage----------
hist(x, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
object of PilotData
对象PilotData
参数:...
additional arguments to hist
额外的参数hist
Details
详情----------Details----------
p-values calculated under the null hypothesis (non-differentially expressed genes) are assumed to be uniformly distributed on [0,1]. p-values calculated under the alternative hypothesis (differentially expressed genes) are assumed to accummelated near zero. The height of the flat part of the histogram is an indication of how many hypothesis are calculated under the null hypothesis.
根据无效假设(非差异表达的基因)计算p值被假定为均匀分布在[0,1]。根据计算的替代假说(差异表达的基因)的P-值接近零accummelated假设。直方图的平坦部分的高度是多少假设,零假设下计算的指示。
值----------Value----------
an object of class "histogram", see hist.
“直方图”类的一个对象,看到hist。
作者(S)----------Author(s)----------
Maarten van Iterson
参见----------See Also----------
hist and plot
hist和plot
举例----------Examples----------
library(multtest)
data(golub)
teststat <- mt.teststat(golub, golub.cl)
table(golub.cl)
pd <- pilotData(name="golub", testStatistics=teststat, sampleSizeA=11, sampleSizeB=27)
hist(pd)
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