computeRawQ (sscore)
computeRawQ ()所属R语言包：sscore
Computes RawQ
计算RawQ
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Computes the RawQ value of a single Affymetrix GeneChip
计算单一Affymetrix基因RawQ值
用法----------Usage----------
computeRawQ(fname, intensity, probe.index, probe.zoneID, bgCells, NumberZones, celfile.path = NULL)
参数----------Arguments----------
参数：fname
character string with the filename of the GeneChip
基因芯片的文件名字符串
参数：intensity
vector of intensities for the GeneChip
强度矢量的基因芯片
参数：probe.index
vector of indices for each probe
每个探针指数的向量
参数：probe.zoneID
vector of zone ID numbers for each probe
每个探针带身份证号码的向量
参数：bgCells
number of background cells for the GeneChip
背景单元的基因芯片
参数：NumberZones
number of zones on the GeneChip
基因芯片上的区域数
参数：celfile.path
character denoting the path for the *.CEL files specified in fname
字符表示*fname指定CEL文件的路径。
Details
详情----------Details----------
Calculates RawQ using the algorithms described in the Affymetrix Statistical Algorithms Description Document for a single GeneChip. This is an internal function that will generally not be accessed directly.
计算RawQ使用Affymetrix公司的统计算法描述文件中描述为一个单一的基因芯片的算法。这是一个内部函数，一般不会直接访问。
值----------Value----------
the RawQ value for the given array
RawQ给定的数组值
注意----------Note----------
Based on Affymetrix MAS5 Statistical SDK source code http://www.affymetrix.com/Auth/support/developer/stat_sdk/STAT_SDK_source.zip,
基于Affymetrix公司MAS5统计SDK源代码http://www.affymetrix.com/Auth/support/developer/stat_sdk/STAT_SDK_source.zip的，
作者（S）----------Author(s)----------
Richard Kennedy <a href="mailto:rkennedy@vcu.edu">rkennedy@vcu.edu</a>
参考文献----------References----------
Inc., Santa Clara, CA, whitepaper. http://www.affymetrix.com/support/technical/whitepapers/sadd_whitepaper.pdf
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
|
发表于 2012-2-26 15:05:08
