R语言 spotSegmentation包 spotSegTest()函数中文帮助文档(中英文对照)

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spotSegTest(spotSegmentation)
spotSegTest()所属R语言包：spotSegmentation

                                        Spot Segmentation Test Data
                                         现货分割测试数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The two columns of this data set represent the Cy3 (green) absorption  intensities for channel 1, and the Cy5 (red) absorption intensities for channel 2 for part of a dye-swap experiment with replicates. They measure expression levels of  cellular RNA transcripts assessed in CD4+ T cell lines at different  times after infection with HIV-1BRU using DNA microarrays.
这组数据的两列表示通道1，（红色）通道2的Cy5的吸收强度Cy3标记（绿色）吸收强度与复制的染料交换实验的一部分。他们在不同的时间测量与HIV-1BRU的使用DNA芯片后感染单元的RNA转录表达水平评估中CD4 + T单元系。


用法----------Usage----------


data(spotSegTest)



格式----------Format----------

Each column is a vector of intensities of 24 spots arranged in  4 rows and 6 columns, encoded for compact (16-bit TIFF) storage. For processing each column of spotSegTest  should first be converted to a 144x199 matrix, then applying the transformation described below.
每一列是一个强度排列成4行6列的24个景点，紧凑编码（16位TIFF）存储向量。为处理每列spotSegTest首先应该被转换到144x199矩阵，然后应用下面描述的转型。


Details

详情----------Details----------

The intensities can be obtained from this data by first  subtracting them from 65535 (256*256-1), then squaring, then multiplying by  a scale factor 4.71542407E-05. In other words, a number x in the spotSegTest data set
从这个数据可以得到强度，首先减去他们从65535（256 * 256-1），然后现蕾，然后乘以一个比例因子4.71542407E-05。换句话说，数字xspotSegTest数据集


源----------Source----------

Dr. Angelique van't Wout, Department of Microbiology,  University of Washington\ The data is a subset the first block of a 12 block array image (001030\_08\_1.GEL) in the first data set (2000095918 A) in the first experiment (CEM LAI vs HI-LAI 24hr) of the following data archive:\ http://expression.microslu.washington.edu/expression/vantwoutjvi2002.html
安琪莉范特Wout博士，微生物学系，华盛顿大学\数据的一个子集的首块12块阵列（001030\_08\_1.GEL）在第一个数据集（2000095918 A）第一个实验中（CEM LAI vs HI-LAI 24hr）以下数据归档：\ http://expression.microslu.washington.edu/expression/vantwoutjvi2002.html


参考文献----------References----------

Geiss GK, Mullins JI\ Cellular gene expression upon human immunodeficiency virus type 1 infection of CD4(+)-T-cell lines.\ J Virol. 2003 Jan;77(2):1392-402.
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