R语言 spkTools包 spkSlope()函数中文帮助文档(中英文对照)

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spkSlope(spkTools)
spkSlope()所属R语言包：spkTools

                                        Signal Detect Slope Plot
                                         信号检测边坡图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots observed expression vs. nominal concentration. The overall regression slope, as well as, regression slopes for low, medium, and high bins are computed and the regression lines plotted.
图观察表达与标称浓度。整体回归斜率，以及低，中，高箱的回归斜率计算和绘制回归线。


用法----------Usage----------


spkSlope(object, label = NULL, cuts=c(.6,.99), ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
a SpikeInExpressionSet object
1 SpikeInExpressionSet对象


参数：label
a character string to insert into the plot title
一个字符串插入到图的标题


参数：cuts
quantiles used to make the low, medium, and high bins
用于低，中位数，和高箱


参数：...
arguments passed to the plot function
参数传递给绘图功能


Details

详情----------Details----------

The bins are created by computing the proportion of non-spike-in genes with expression values less than or equal to the average expression value at each nominal concentration. Using the default value of cuts, the high bin contains nominal concentrations with 99 percent or more of the non-spike-in expression  values lower than it. The medium bin contains nominal concentrations with between 60 and 99 percent of the non-spike-in expression values lower than it. The low bin contains nominal concentrations with less than 60 percent of the non-spike-in expression values lower than it.
创建计算表达式的值小于或等于平均在面值浓度的表达式的值的比例在非尖峰基因的垃圾箱。削减使用默认值，高彬包含面值99％或更多的表达式的值比在非尖峰低浓度。中期bin包含60至99％的非穗表达名义浓度值比它低。低槽包含名义浓度小于60％的表达式的值比在非尖峰低。


值----------Value----------


参数：avgExp
average expression at each nominal concentration
平均面值浓度表达


参数：slopes
the regression slopes - overall and for each bin
回归斜坡 - 整体和每个垃圾桶


参数：breaks
which spike-in levels fall in each bin
穗水平下降在每个垃圾桶


参数：brkpts
the expression value of the cut points between bins
箱之间的切点表达式的值


参数：prop
the proportion of non-spike-in probes with expression less than the average expression at each nominal concentration
的在面值浓度比例小于平均表达的表达非穗探针


作者（S）----------Author(s)----------


Matthew N. McCall



举例----------Examples----------


data(affy)
spkSlope(affy)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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