spkPot(spkTools)
spkPot()所属R语言包:spkTools
Probability of being in the Top
热门的概率
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Compute the probability that a spike-in with a nominal fold change of 2 appears in the the top 0.5% (default) of log-ratios.
计算尖峰顶端log比率为0.5%(默认)2倍的名义变化出现的概率。
用法----------Usage----------
spkPot(object, spkSlopeOut, sig, SD, precisionQuantile)
参数----------Arguments----------
参数:object
a SpikeInExpressionSet object
1 SpikeInExpressionSet对象
参数:spkSlopeOut
the output from the spkSlope function
从spkSlope函数的输出
参数:sig
the signal detect slopes from a call to spkSlope
从调用spkSlope到斜坡信号检测
参数:SD
the standard deviation from spkAccSD
从spkAccSD标准偏差
参数:precisionQuantile
the desired quantile to compute the probability of being above
所需的位数来计算的是以上的概率
值----------Value----------
A vector of probabilities for each ALE strata.
每个ALE地层的概率向量。
作者(S)----------Author(s)----------
Matthew N. McCall
举例----------Examples----------
data(affy)
affySlope <- spkSlope(affy)
affyAccSD <- spkAccSD(affy, affySlope)
spkPot(affy, affySlope, affySlope$slopes, affyAccSD, .995)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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