spkMA(spkTools)
spkMA()所属R语言包:spkTools
MA Plots
主图解
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plots log-ratios (M) vs. average log expression (A) for a SpikeInExpressionSet object.
图log比率(男)和平均log表达(一)为SpikeInExpressionSet对象。
用法----------Usage----------
spkMA(object, spkSlopeOut, fc=2, tol=3, label=NULL, ylim=NULL,
outlier=1, reduce=TRUE, plot.legend=TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:object
a SpikeInExpressionSet object
1 SpikeInExpressionSet对象
参数:spkSlopeOut
the output from the spkSlope function
从spkSlope函数的输出
参数:fc
the fold change of interest
倍的利率变化
参数:tol
the precision (number of digits after decimal point) in fc
在FC的精度(小数点后的位数)
参数:label
a character string to insert into the plot title
一个字符串插入到图的标题
参数:ylim
limits of y-axis
Y-轴的限制
参数:outlier
log fold change cut-off for outliers
为离群登录切断倍变化
参数:reduce
if TRUE some points are removed from the background to speed plotting
如果为TRUE删除一些点从背景,以加快绘图
参数:plot.legend
if TRUE a legend is plotted
如果为TRUE传说绘制
值----------Value----------
The MA plot is produced.
主图产生。
作者(S)----------Author(s)----------
Matthew N. McCall
举例----------Examples----------
data(affy)
affySlope <- spkSlope(affy)
spkMA(affy, affySlope)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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