R语言 SPIA包 colorectalcancer()函数中文帮助文档(中英文对照)

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colorectalcancer(SPIA)
colorectalcancer()所属R语言包：SPIA

                                        Results from a microarray experiment comparing colorectal cancer samples and normal tissue samples.
                                         从芯片比较大肠癌标本和正常组织样本的实验结果。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The colorectal dataset consists: i) an named vector DE_Colorectal , which represents the $log2$ fold changes of the genes chosen as differentially expressed between  colorectal cancer and normal samples based on data from Hong et al, 2007, using a $FDR=0.1$ and  the universe of all Entrez gene IDs available on the array, ALL_Colorectal. These two vectors were obtained starting from the top dataframe which is the output from the topTable function of the limma package using the RMA processed gene expression data downloaded from  GEE (GSE4107). The microarray platform used was Affymetrix HGU-133PLUS2.0.
colorectal集组成：I）命名为向量DE_Colorectal，这代表元log2 $倍的基因选择之间的差异大肠癌和正常样本基于数据等，2007年从香港表示变化，使用$FDR= 0.1元和宇宙的所有的Entrez基因ID阵列，ALL_Colorectal。这两个向量获得topdataframe这是从功能的“limma包使用的RMA处理的基因表达，GEE下载数据（GSE4107）topTable输出开始。所使用的芯片平台是Affymetrix公司HGU-133PLUS2.0。


用法----------Usage----------


data(colorectalcancer)



源----------Source----------

Yi Hong and  Kok Sun Ho and  Kong Weng Eu and  Peh Yean Cheah, A susceptibility gene set for early onset colorectal cancer that integrates diverse signaling pathways: implication for tumorigenesis, Clin Cancer Res, 2007, 13(4),1107-14.
易红角孙豪和香港翁欧盟和白振华沅谢氏，一个易感基因为发病早期大肠癌，集成了不同的信号通路设置：肿瘤的发生，世界华人消化杂志，2007，13（4）,1107-14的含义。

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