write.SnpMatrix(snpStats)
write.SnpMatrix()所属R语言包:snpStats
Write a SnpMatrix object as a text file
作为一个文本文件写SnpMatrix对象
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function is closely modelled on write.table. It writes an object of class SnpMatrix as a text file with one line for each row of the matrix. Genotpyes are written in numerical form, i.e. as 0, 1 or 2 (where 1 denotes heterozygous) or, optionally, as a pair of alleles (each coded 1 or 2).
此功能密切仿照write.table。它写入一个对象类SnpMatrix作为一个矩阵的每一行的行的文本文件。 genotpyes以数字形式被写入,即0,1或2个(其中1表示杂合子),或选择性,作为一对等位基因(每个编码1或2)。
用法----------Usage----------
write.SnpMatrix(x, file, as.alleles= FALSE, append = FALSE, quote = TRUE, sep = " ", eol = "\n", na = "NA", row.names = TRUE, col.names = TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:x
The object to be written
要写入的对象
参数:file
The name of the output file
输出文件的名称
参数:as.alleles
If TRUE, write each genotype as two alleles
如果TRUE,写两个等位基因,每个基因型
参数:append
If TRUE, the output is appended to the designated file. Otherwise a new file is opened
如果TRUE输出追加到指定的文件。否则,一个新的文件被打开
参数:quote
If TRUE, row and column names will be enclosed in quotes
如果将包含在引号TRUE,行和列名
参数:sep
The string separating entries within a line
行内字符串分隔条目
参数:eol
The string terminating each line
每行终止字符串
参数:na
The string written for missing genotypes
缺失基因型写的字符串
参数:row.names
If TRUE, each row will commence with the row name
如果TRUE,每行开始,该行名称
参数:col.names
If TRUE, the first line will contain all the column names
如果TRUE,第一行会包含所有的列名
值----------Value----------
A numeric vector giving the dimensions of the matrix written
一个数值向量,给予书面矩阵尺寸
作者(S)----------Author(s)----------
David Clayton <a href="mailto:david.clayton@cimr.cam.ac.uk">david.clayton@cimr.cam.ac.uk</a>
参见----------See Also----------
write.table, SnpMatrix-class,
write.table,SnpMatrix-class
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注:
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