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R语言 snpStats包 plotUncertainty()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 14:44:59 | 显示全部楼层 |阅读模式
plotUncertainty(snpStats)
plotUncertainty()所属R语言包:snpStats

                                         Plot posterior probabilities of genotype assignment
                                         图基因型分配后验概率

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The snpStats package allows for storage of uncertain genotype assignments in a one byte "raw" variable. The probabilities of assignment form a three-vector, subject to the linear constraint that they sum to 1.0; their possible values are grouped into 253 different classes. This function displays counts of these classes on a two-dimensional isometric plot.
snpStats包可以存储在一个字节的“原始”的变量的不确定基因型分配。被分为253个不同类别的分配形式的三向量的线性约束,他们的总和为1.0;其可能值的概率。此功能显示这些类的一个两维的等距图计数。


用法----------Usage----------


plotUncertainty(snp, nlevels = 10, color.palette = heat.colors(nlevels))



参数----------Arguments----------

参数:snp
One or more columns of a SnpMatrix object  
SnpMatrix对象的一个或多个列


参数:nlevels
Probability cells are coloured according to frequency. This argument gives the number of colours that can be used  
概率单元是彩色的,根据频率。这种说法提供了可以使用的颜色数


参数:color.palette
The colour palette to be used  
要使用调色板


Details

详情----------Details----------

The plot takes the form of an equilateral triangle in which each apex represents a certain assignment to one of the three genotypes. A point within the triangle represents, by the perpendicular distance from each side, the three probabilities. Each of the 253 probability classes is represented by a hexagonal cell, coloured according to its frequency in the data, which is also written within the cell
图需要一个等边三角形的形式,其中每个顶点代表了一定的分配到三种基因型。三角形内点表示,从每边的垂直距离,三个的概率。 253概率类每一个六角形单元,有色表示,根据其频率的数据,这也是单元内的书面


作者(S)----------Author(s)----------


David Clayton <a href="mailto:david.clayton@cimr.cam.ac.uk">david.clayton@cimr.cam.ac.uk</a>



举例----------Examples----------


## No example available yet[#没有例子还]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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