R语言 snpStats包 mvtests()函数中文帮助文档(中英文对照)

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mvtests(snpStats)
mvtests()所属R语言包：snpStats

                                        Multivariate SNP tests
                                         多元的SNP检测

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function calculates multivariate score tests between a multivariate (or multinomial) phenotype and sets of SNPs
此函数计算多元（或多项）表型和成套的单核苷酸多态性之间的多元得分测试


用法----------Usage----------


mvtests(phenotype, sets, stratum, data = sys.parent(), snp.data, rules = NULL, complete = TRUE, uncertain = FALSE, score = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：phenotype
Either a factor (for a multinomial phenotype) or a matrix (for a multivariate phenotype)  
无论是因子（多项式型）或矩阵（多元型）


参数：sets
A list of sets of SNPs to be tested against the phenotype  
对表型检测的单核苷酸多态性集列表


参数：stratum
(Optional) a stratifying variable  
（可选）分层变量


参数：data
A data frame in which phenotype and stratum reside. If absent these are assumed to be in the parent frame and correctly aligned with the rows of snp.data  
在一个数据框phenotype和stratum居住。如果不在这些被假定为在父框架和正确与snp.data行对齐


参数：snp.data
An object of class SnpMatrix containing the SNP data  
一个对象的类SnpMatrix包含的SNP数据


参数：rules
(Optional) A set of imputation rules. The function then carries out tess on imputed SNPs  
（可选）设置归责原则。然后该函数进行了估算单核苷酸多态性的苔丝“


参数：complete
If TRUE each test will use only subjects who have complete data for the phenotype and all SNPs in the set to be tested. If FALSE, then complete data for the phenotype is required, but tests are based upon complete pairs of SNPs  
如果TRUE每次测试将使用唯一的科目有型和单核苷酸多态性在所有进行测试的一套完整的数据。 FALSE如果，然后完整的表型数据是必需的，但测试后，完整的单核苷酸多态性对基于


参数：uncertain
If TRUE, uncertain genotype calls will be used in the tests (scored by their posterior expectations). Otherwise such calls are treated as missing  
如果TRUE，不确定基因型分型将被用来测试后期望取得的。否则，这样的检测被视为失踪


参数：score
If TRUE, the score vectors and their variance-covariance matrices are saved in the output object for further processing  
TRUE如果，得分向量，其协方差矩阵被保存在输出对象进行进一步的处理


Details

详情----------Details----------

Currently complete=FALSE is not implemented
目前complete=FALSE未实现


值----------Value----------

An object of class snp.tests.glm or GlmTests.score depending on whether score is set to FALSE or TRUE in the call
一个类的对象snp.tests.glm或GlmTests.score取决于是否score设置为FALSE或TRUE在调用


注意----------Note----------

This is an experimental version
这是一个实验性的版本


作者（S）----------Author(s)----------


David Clayton <a href="mailto:david.clayton@cimr.cam.ac.uk">david.clayton@cimr.cam.ac.uk</a>



举例----------Examples----------


## No example yet[＃没有例子]

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注：
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