R语言 SNPchip包 smoothSnp()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

smoothSnp(SNPchip)
smoothSnp()所属R语言包：SNPchip

                                        A simple nonparametric smoother for genotype and copy number
                                         一个简单的非参数平滑的基因型和拷贝数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A loess smoother for finding regions of reduced copy number and loss of heterozygosity.
一个寻找减少拷贝数和杂合性丢失的区域黄土顺畅。


用法----------Usage----------


smoothSnp(object, ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
Object derived from AnnotatedSnpSet
从AnnotatedSnpSet对象派生的


参数：...
For additional arguments see details.
额外的参数，看到细节。


Details

详情----------Details----------

Additional arguments include the chromosomes (character vector) and samples (numerical vector) to smooth.  Options for smoothing are set by specifying the span and the method.  See the SNPchip vignette.
额外的参数，包括染色体（特征向量）和样品（数字向量）顺利。平滑选项设置指定的跨度和方法。看到SNPchip暗角。

See the R package VanillaICE for a hidden Markov model for more formal inference regarding regions of LOH and copy number alterations.
见有关区域蕙和拷贝数改变的较正式的推理隐马尔可夫模型的R包VanillaICE。


值----------Value----------

An object of the same class, e.g., AnnotatedSnpSet, where assayData elements copyNumber and calls are replaced by the smoothed values.
同一类的，如AnnotatedSnpSet，平滑值取代的assayData元素copyNumber和检测的对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Robert Scharpf



参考文献----------References----------

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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