runTilingArray(snapCGH)
runTilingArray()所属R语言包:snapCGH
Results of segmenting an MAList data object using the Picard et
一个MAList数据对象使用Picard等的分割结果
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Wrapper calling the Tiling Array segmentation algorithm on an MAList object. This function requires the library DNAcopy to be loaded.
包装调用瓦片阵列分割算法上MAList对象。此功能需要库DNAcopy要加载。
用法----------Usage----------
runTilingArray(input, maxSeg = 5, maxk = 200, criteria = "BIC")
参数----------Arguments----------
参数:input
An object of class MAList or SegList
一个对象类MAList或SegList
参数:maxSeg
integer of length 1, maximum number of segments (= 1 + maximum number of change points)
整数长度为1,最大段数(= 1 +的最大数量的变化点)
参数:maxk
integer of length 1, maximum length of a single segment
长度为1的整数,一个单段最大长度
参数:criteria
Criteria for model selection. Options are "none", "AIC" and "BIC" (default)
模型选择标准。选项是“无”,“工商局”和“的BIC”(默认)
值----------Value----------
The function returns an object of class SegList
该函数返回一个对象类SegList
作者(S)----------Author(s)----------
Mike Smith
参见----------See Also----------
segment MAList runHomHMM runGLAD SegList
segmentMAListrunHomHMMrunGLADSegList
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注:
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