mergeStates(snapCGH)
mergeStates()所属R语言包：snapCGH
Function to merge states based on their state means
功能合并其状态为基础的国家是指
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
mergeStates takes the output of a segmentation algorithm in the form of a SegList and iteratively merges the states with means closer than a supplied threshold.
mergeStates的形式分割算法的输出SegList和反复合并意味着比提供的阈值接近的状态。
用法----------Usage----------
mergeStates(segList, MergeType = 1, pv.thres=0.0001, ansari.sign=0.01, minDiff = 0.25)
参数----------Arguments----------
参数：segList
Object of class SegList.
对象类SegList。
参数：MergeType
Select either 1 or 2. 1 uses a new merging algorithm developed by Hanni Willenbrock and Jane Fridlyand.
选择1或2。 1使用一种新算法由汉尼Willenbrock和简Fridlyand的发展的。
参数：pv.thres
Significance threshold for Wilcoxon test for level merging. Used when MergeType = 1.
级别合并为秩试验意义的阈值。使用时MergeType = 1。
参数：ansari.sign
Significance threshold for Ansari-Bradley test. Used when MergeType = 1.
安萨里 - 布拉德利试验意义的阈值。使用时MergeType = 1。
参数：minDiff
The states whose predicted values are less than minDiff apart are merged into one state and all the predicted values are recomputed. Used when MergeType = 2.
除了国家的预测值比minDiff合并成一个国家，所有的预测值重新计算。使用时MergeType = 2。
Details
详情----------Details----------
This function is intended to reduce effect of the possible small magnitude technological artifacts on the structure determination.
此功能是为了减少结构测定的影响可能小幅度的科技文物。
值----------Value----------
A SegList object is returned with the merged states stored in the pred list.
返回一个SegList对象与pred列表中合并后的状态。
作者（S）----------Author(s)----------
Jane Fridlyand
参考文献----------References----------
array CGH data, Fridlyand et.al., JMVA, 2004
参见----------See Also----------
SegList, runHomHMM, runGLAD, runDNAcopy
SegList，runHomHMM，runGLAD，runDNAcopy
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发表于 2012-2-26 14:34:34
