R语言 SMAP包 SMAPHMM()函数中文帮助文档(中英文对照)

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SMAPHMM(SMAP)
SMAPHMM()所属R语言包：SMAP

                                        Constructor for "SMAPHMM" objects
                                         的“SMAPHMM”对象的构造函数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A constructor for SMAPHMM-class objects.
SMAPHMM-class对象的构造。


用法----------Usage----------


SMAPHMM(noStates, Phi, A=NULL,
        Pi=rep(1/noStates,noStates),
        initTrans=0.2/(noStates - 1))



参数----------Arguments----------

参数：noStates
The number of hidden states in the HMM (numeric).
在隐藏状态的HMM（数字）。


参数：Phi
A Gaussian distribution parameter matrix (numeric).
高斯分布参数矩阵（数字）。


参数：A
A noStates * noStates matrix of transition probabilities betweeen the hidden states (numeric).
一个noStates * noStates betweeen隐藏状态（数字）的转移概率矩阵。


参数：Pi
A vector of initial probabilities of starting in a certain state (numeric).
开始在某些国家（数字）的初始概率向量。


参数：initTrans
Specifies the transition probability between non-equal states (numeric).
指定的非平等状态（数字）之间的转移概率。


Details

详情----------Details----------

Phi is a noStates * 2 matrix that specifies the paramaters of Gaussian distributions associated with each hidden state.  The first column specifies standard deviations, the second specifies means.
Phi是noStates * 2矩阵，指定每个隐藏状态的高斯分布paramaters。第一列中指定的标准偏差，第二个指定的意思。

If A == NULL, initTrans specifies the transition probability between states i and j in 1:noStates, such that i != j. Only used if A ==         NULL. initTrans * noStates must be smaller than (or equal to) 1.
如果A == NULL，initTrans指定状态之间的转移概率i和j1:noStates，i != j。如果A ==         NULL只用。 initTrans * noStates必须大于（或等于）1小。


值----------Value----------

An object of class SMAPHMM-class.
对象类SMAPHMM-class。


作者（S）----------Author(s)----------


Robin Andersson, <a href="mailto:robin.andersson@lcb.uu.se">robin.andersson@lcb.uu.se</a>



参考文献----------References----------

Sandgren, J., Hvidsten, T. R., Diaz de Stahl, T., Dumanski, J. P., Komorowski, J., A Segmental Maximum A Posteriori Approach to Array-CGH Copy Number Profiling, submitted

参见----------See Also----------

smap, SMAPHMM-class, SMAPObservations-class
smap，SMAPHMM-class，SMAPObservations-class

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