R语言 SLGI包 topInteraction()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

topInteraction(SLGI)
topInteraction()所属R语言包：SLGI

                                        Extract interacting biological complexes
                                         提取生物复合物的相互作用

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Extract the top X interacting biological complexes.
提取生物复合物相互作用的顶端X。


用法----------Usage----------


topInteraction(data,top=10)



参数----------Arguments----------

参数：data
Square matrix of biological complexes that shares one or more genes(proteins)
生物复合物的方阵，股份的一个或多个基因（蛋白质）


参数：top
Interger that represents the percentage of interacting complexe
基于整数表示相互作用的配合物的百分比


值----------Value----------

Data frame of biological complexes that interact. The first two columns are the cellular organizational units names and the third column indicates the number of interactions.
数据框的生物复合物的相互作用。前两列单元的组织单位名称，第三列表示的互动。


作者（S）----------Author(s)----------


N. LeMeur



举例----------Examples----------


data(Atong)
data(ScISIC)
data(SGA)
SLa2 <- gi2Interactome(Atong, ScISIC)
## Search for synthetic lethal interaction[＃搜索合成致命的相互作用]
compM <- getInteraction(SLa2, SGA, ScISIC)
top10Interaction<- topInteraction(compM$bwMat,top=10)

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