R语言 SLGI包 iSummary()函数中文帮助文档(中英文对照)

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iSummary(SLGI)
iSummary()所属R语言包：SLGI

                                        Summarize cellular organizational units sharing genetic interaction
                                         总结分享遗传相互作用的单元组织单位

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Summarize the cellular organizational units sharing genetic
总结分享遗传单元的组织单位


用法----------Usage----------


iSummary(iMat, n=10, reverse=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：iMat
Comembership matrix of genes(proteins) that linked to other genes(proteins) by any biological experiment, e.g., output of the getInteraction function.
comembership基质（蛋白质）的基因与任何生物实验，如getInteraction函数输出到其他基因（蛋白质）。


参数：n
Numeric threshold indicating the minimum number of genetic interactions that a pair of cellular organizational unit must share.
数字阈值，说明遗传相互作用，单元组织单位对必须共享的最低数量。


参数：reverse
Logical, by default the function return a list of pair of cellular organizational units where the name of each element is the number of genetic interactions they share. If reverse is TRUE, the output is a vector where the values are the number of interactions and the names are the combination of the 2 cellular organizational units.
逻辑，默认情况下，函数返回一个列表，其中每个元素的名称是他们共同的遗传相互作用对单元组织单位。如果正好相反，输出值是相互作用的数量和名称2单元组织单位的组合是一个向量。


值----------Value----------

The function print the result in the standard output but can also save it in variable.
该函数打印在标准输出的结果，但也可以将其保存在变量。

If reverse is FALSE the output is a list of pairs of cellular organizational units where the name of each element is the number of genetic interactions they share.
reverse如果是FALSE的输出是对其中的每个元素的名称是他们共同的遗传相互作用的单元组织单位的名单。

If reverse is TRUE the output is a vector where the values are the number of interactions and the names are the combination of the 2
reverse如果是TRUE的输出值是相互作用的数量和名称是2的组合是一个向量


作者（S）----------Author(s)----------


N. LeMeur



举例----------Examples----------


data(Atong)
data(ScISIC)
data(SGA)
SLa2 <- gi2Interactome(Atong, ScISIC)
## Search for synthetic lethal interaction[＃搜索合成致命的相互作用]
compM <- getInteraction(SLa2, SGA, ScISIC)
## Display the tightly interacting pairs[＃显示的紧密的相互作用对]
largeInt <- iSummary(compM$bwMat,n=15)

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