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R语言 SLGI包 getFASTAname()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 14:27:26 | 显示全部楼层 |阅读模式
getFASTAname(SLGI)
getFASTAname()所属R语言包:SLGI

                                         Obtain sequence name from FASTA object
                                         FASTA格式的对象,获得序列的名称

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Extract the name of a sequence from a FASTA object that created by readFASTA function from Biostrings package.
提取readFASTABiostrings包的功能创建一个FASTA对象序列名。


用法----------Usage----------


getFASTAname(Fobj)



参数----------Arguments----------

参数:Fobj
is a FASTA object created by readFASTA function from Biostrings
是一个FASTA对象创建readFASTA从Biostrings功能,


Details

详情----------Details----------

The function gets the first string between ">" and space the "desc" element of the Fobj, which is the names of the sequence.
该函数获得的的Fobj,这是序列的名字“DESC”元素“>”和空间之间的第一个字符串。


值----------Value----------

A character string.
一个字符串。


作者(S)----------Author(s)----------


Z. Jiang



参见----------See Also----------

readFASTA
readFASTA


举例----------Examples----------


f <- gzfile(file.path(.path.package("SLGI"),
            "extdata/orf_trans.fasta.gz"), open = "rt")
library(Biostrings)
yeastF <- readFASTA(f)
sapply(yeastF[1:5], getFASTAname)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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