R语言 SIM包 RESOURCERER.annotation.to.ID()函数中文帮助文档(中英文对照)

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RESOURCERER.annotation.to.ID(SIM)
RESOURCERER.annotation.to.ID()所属R语言包：SIM

                                        Link RESOURCERER annotation file to expression ID
                                         链接RESOURCERER注释文件，以表达编号

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Get annotation out of the RESOURCERER annotation file and link them to expression data with help of expression ID's
获取注释的RESOURCERER注释文件，并帮助他们表达ID的链接来表达数据


用法----------Usage----------


RESOURCERER.annotation.to.ID(data, poslist, col.ID.link = 1, col.poslist.link = 1)



参数----------Arguments----------

参数：data
data.frame with expression data including an expression ID column.
数据框与表达数据，包括一个表达式ID列。


参数：poslist
data.frame containing the RESOURCERER annotation file
数据框包含的RESOURCERER注释文件


参数：col.ID.link
numeric value, specifying the column of data that contains the ID to link with the poslist.
数值，指定的列data包含ID连接poslist。


参数：col.poslist.link
numeric value, specifying the column of poslist that contains the ID to link with the data.
数值，指定的列poslist包含ID连接data。


Details

详情----------Details----------

This function will output the inserted dataset, including the necessary, for integrated.analysis, a nnotation columns: "CHROMOSOME", "STARTPOS"and "Symbol" out of the inserted RESOURCE RER annotation file poslist.
此功能将输出包括必要的插入数据集，为integrated.analysis，nnotation列："CHROMOSOME"，"STARTPOS"和"Symbol"出插入的资源RER的注释文件poslist。 。


值----------Value----------

A data.frame is returned, containing a dataset with annotation columns which can be used for
一个data.frame返回，可用于注释列包含数据集


作者（S）----------Author(s)----------


Marten Boetzer, Melle Sieswerda, Renee x Menezes  <a href="mailto:R.X.Menezes@lumc.nl">R.X.Menezes@lumc.nl</a>



参见----------See Also----------

link.metadata
link.metadata


举例----------Examples----------



# download expression array annotation from RESOURCERER ftp://occams.dfci.harvard.edu/pub/bio/tgi/data/Resourcerer[下载表达从RESOURCERER ftp://occams.dfci.harvard.edu/pub/bio/tgi/data/Resourcerer阵列注解]
# it may be necessary to remove the first row, which states the genome build used for mapping[它可能需要删除第一行，其中基因组构建用于映射]
## Not run: read.an &lt;- read.delim("affy_U133Plus2.txt", sep="\t", header=T) [＃无法运行：read.an < -  read.delim（的“affy_U133Plus2.txt”，SEP =“\ T”，头= T）]

# get physical mapping columns[获得物理映射列]
## Not run: expr.data &lt;- RESOURCERER_annotation_to_ID(data = read.expr, poslist = read.an, col.ID.link = 1, col.poslist.link = 1)[＃无法运行：expr.data < -  RESOURCERER_annotation_to_ID（数据= read.expr，poslist = read.an，col.ID.link = 1，col.poslist.link = 1）]

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