get.fold.change.and.t.test(simpleaffy)
get.fold.change.and.t.test()所属R语言包:simpleaffy
Compute fold change and t-test statistics between two experimental groups
两实验组之间的t检验统计计算倍数变化
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Generate fold changes (and possibly means) for a pair of experimental groups
对实验组产生褶皱的变化(可能意味着)
用法----------Usage----------
get.fold.change.and.t.test(x,group,members,logged = TRUE,a.order=NULL,b.order=NULL,method=c("unlogged","logged","median"));
参数----------Arguments----------
参数:x
an ExpressionSet object.
ExpressionSet对象。
参数:group
column in pData(x).
在的PDATA列(X)。
参数:members
labels in group.
组的标签。
参数:logged
is the AffyBatch data logged?
是AffyBatch数据记录?
参数:a.order
For a pairwise comparison the ordering of the first group of replicates
对于成对比较,第一组的顺序复制
参数:b.order
For a pairwise comparison the ordering of the second group of replicates
第二组的顺序复制一个成对比较
参数:method
What method should be used to calculate the average for the fold-change - can be either "logged","unlogged","median"
应该用什么方法来计算平均倍变化 - 可以是“记录”,“未记录”,“中位数”
Details
详情----------Details----------
Given an ExpressionSet object, generate quick stats for pairwise comparisons between a pair of experimental groups. If a.order and b.order are specified then a paired sample t-test will be conducted between the groups, with the arrays in each group sorted according to the ordering specified.
给予ExpressionSet对象,对实验组之间两两比较快速统计。 ,如果a.order和b.order然后指定将配对样本t检验各组之间进行,每组阵列根据订货指定排序。
The fold-changes are computed from the average values across replicates. By default this is done using the mean of the unlogged values. The parameter, method allows the mean of the logged values or the median to be used instead. T-tests are always computed with the logged data.
从整个复制的平均值计算的fold change。默认情况下,这样做是使用的未记录的值的平均值。参数,方法允许记录值的平均值的中位数,用来代替。 t-检验记录的数据计算。
值----------Value----------
An object of class PairComp
一个类PairComp的对象
作者(S)----------Author(s)----------
Crispin J Miller
参考文献----------References----------
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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