R语言 simpleaffy包 get.annotation()函数中文帮助文档(中英文对照)

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get.annotation(simpleaffy)
get.annotation()所属R语言包：simpleaffy

                                         Get annotation data for a gene list
                                         得到的基因列表的注释数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Takes a vector of probeset names and a CDF name. Produces a table of annotations, containing gene name, description, sequence accession number and unigene accession number for each probeset. In addition, write.annotation is a utility function that outputs the annotation data in a form suitable for loading into excel and results.summary takes the outut of pairwise.comparison or pairwise.filter and spits out a table with the means of the replicates the fold-change between them (log2) and t-test p-values. This is followed by a table of annotation (produced by get.annotation).
需要向量probeset名称和民防部队的名称。产生一个注解表，含有基因名称，描述，顺序加入数量和每个probeset UniGene的加入号码。此外，的write.annotation是一个实用的功能，注释数据和输出的形式适合于加载到Excel，和results.summary的pairwise.comparison或pairwise.filter outut吐出一个表的手段复制倍（log2）和t检验的p值之间的变化。其次是表（由get.annotation生产）的注解。


用法----------Usage----------


get.annotation(x, cdfname,verbose=FALSE)
write.annotation(summary,file="results/annotation.table.xls")
results.summary(results,cdfname)



参数----------Arguments----------

参数：x
a vector of probe names  
探针名称的向量


参数：cdfname
the name of the chip (as produced by cdfName(AffyBatch)  
芯片的名称（如生产cdfName（AffyBatch）


参数：verbose
print out information if problems are found looking things up in the annotation data  
打印出的信息，如果发现问题，寻找东西在注释数据


参数：summary
a table of data to write in a format appropriate to read into Excel  
表写在适当的格式的数据读取到Excel


参数：file
a table delimited file  
表分隔的文件


参数：results
a PairComp object, as produced by pairwise.comparison and pairwise.filter  
1 PairComp对象，生产由pairwise.comparison和pairwise.filter


值----------Value----------

A table containing annotation data
含标注数据表


作者（S）----------Author(s)----------


Crispin J Miller



参考文献----------References----------

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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