R语言 simpleaffy包 call.exprs()函数中文帮助文档(中英文对照)

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call.exprs(simpleaffy)
call.exprs()所属R语言包：simpleaffy

                                         Generate Expression Summaries for Affymetrix Data
                                         Affymetrix数据生成表达摘要

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generates expression summaries and normalizes Affymetrix data using either MAS5.0, GCRMA or RMA algorithms.
产生表达的总结和恢复正常使用或者MAS5.0，GCRMA或RMA算法的Affymetrix数据。


用法----------Usage----------


call.exprs(x, algorithm = "rma", do.log = TRUE, sc = 100, method = NA)



参数----------Arguments----------

参数：x
an AffyBatch object  
AffyBatch对象


参数：algorithm
one of '"rma","rma-R","gcrma", "mas5", "mas5-R". "rma" and "mas5" make use of a native C-library and are faster than "rma-R" and "mas5-R".   
“”RMA“，”RMA-R的“，”gcrma“，”mas5“，的”mas5-R的“之一。 “RMA”和“mas5”使用本地C库和速度比“RMA-R”的的“mas5-R的”。


参数：do.log
return logged data if true   
返回记录的数据，如果属实


参数：sc
if the mas5 algorithm is being used, sets the target intensity to which the chips should be scaled.   
如果正在使用mas5算法，芯片应扩大到设定的目标强度。


参数：method
The algorithm used to normalise the data. Has no effect for "rma", defaults to quantile normalisation for "rma" and no normalisation for "mas5"   
该算法用于数据标准化。有没有效果，为“RMA”位数标准化“RMA”默认并没有为“mas5”的标准化


值----------Value----------

An AffyBatch object containing expression summaries.
一个AffyBatch对象，其中包含表达摘要。


作者（S）----------Author(s)----------


Crispin J Miller



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>   <code>read.affy</code>, <code>expresso</code>,

举例----------Examples----------


  ## Not run: [＃无法运行：]
    eset.rma  <- call.exprs(eset,"rma");
    eset.mas5 <- call.exprs(eset,"mas5");
  
## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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