R语言 sigPathway包 MuscleExample()函数中文帮助文档(中英文对照)

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MuscleExample(sigPathway)
MuscleExample()所属R语言包：sigPathway

                                        Subset of Inflammatory Myopathy Dataset to Demonstrate
                                         炎症性肌病的数据集的子集证明

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

MuscleExample is an R workspace containing the following objects: (1) tab:        a matrix of 5000 rows and 15 columns (2) phenotype:  a indicator vector which denotes which columns in tab are arrays from normal (NORM) and inclusion body myositis (IBM) (3) G:  a list containing the source, title, and the probe set IDs associated with 626 pathways
MuscleExample是一个R工作区包含以下对象：（1）（2）tab：5000行和15列的矩阵phenotype：指标向量表示的列在< x>是正常的阵列（范）和包涵体肌炎（IBM）（3）tab：一个列表，其中包含的源代码，标题，探针组ID相关联的626途径

The full inflammatory myopathway dataset (which includes all probe sets and samples, including more NORM, IBM, and dermatomyositis arrays) and a more comprehensive pathway annotation list for the HG-U133A and other selected array platforms are available at http://www.chip.org/~ppark/PNAS05/
位于http://www提供了完整的的炎症myopathway集（其中包括所有的探针台和样品，包括更多的准则，IBM公司和皮肌炎阵列）和更全面的途径为HG-U133A和其他选定的阵列平台的注解列表。 chip.org /~ppark/PNAS05 /

Although the objects contained in MuscleExample are subsets of the full dataset, the results obtained from running pathway analysis with MuscleExample are comparable to those obtained using the full dataset.  This example dataset contains 8 IBM and 7 NORM arrays. The 5000 probe sets were selected by considering the variance of the expression values of each probe set among the 15 arrays.
虽然对象包含在MuscleExample完整的数据集的子集，得到的结果运行MuscleExample与使用完整的数据集获得的途径分析。本示例数据集包含8 IBM和7范阵列。 5000探针组被选定考虑每个探针在15阵列设置的表达式值的方差。


用法----------Usage----------


data(MuscleExample)



格式----------Format----------

1 integer matrix, 1 numeric vector, and 1 list
1整数矩阵，数字矢量1和1名单


源----------Source----------

http://www.chip.org/~ppark/PNAS05/



参考文献----------References----------

P.J. (2005)  Discovering statistically significant pathways in expression profiling studies.  Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA, 102, 13544-9.

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