R语言 ShortRead包 SnapshotFunction-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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SnapshotFunction-class(ShortRead)
SnapshotFunction-class()所属R语言包：ShortRead

                                        Class "SnapshotFunction"
                                         类“SnapshotFunction”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A class to store custom reader and viewer functions for the Snapshot class.
A级存储Snapshot类定制的读者和观众职能。


用法----------Usage----------


SnapshotFunction(reader, viewer, limits, ...)
reader(x, ...)
viewer(x, ...)
limits(x, ...)



参数----------Arguments----------

参数：reader
A function for reading data. The function must take a single argument (a Snapshot instance) and return a data.frame summarizing the file.
一个用于读取数据的功能。该函数必须采取一个参数（Snapshot实例），并返回一个data.frame总结文件。


参数：viewer
A function for visualizing the data. The function must accept the data.frame created by reader, and return an SpTrellis object representing the view.
一个可视化的数据的功能。该函数必须接受data.framereader创建，并返回一个SpTrellis对象代表的观点。


参数：limits
An integer(2) indicating the minimum and maximum number of nucleotides the SnapshotFunction is intended to visualize. For instance, a "fine-scale" viewer displaying a pileup might be appropriate at between 1000 and 50000 nucleotides.
一个整数（2）表明核苷酸的最低和最高数量SnapshotFunction旨在形象化。例如，“细规模”的观众，显示1堆积可能是在1000和50000个核苷酸之间的适当。


参数：x
An instance of SnapshotFunction
一个SnapshotFunction的实例


参数：...
Additional arguments, currently unused.
额外的参数，目前尚未使用。


领域----------Fields----------




reader: Object of class function for reading data from BAM files and returning a
reader：function类的对象为从BAM的文件读取数据，并返回一个




viewer: Object of class function for
viewer：function类对象




limits: Object of class integer for the limits
limits：integer类对象的限制


作者（S）----------Author(s)----------


Martin Morgan and Chao-Jen Wong



参见----------See Also----------

Snapshot
Snapshot


举例----------Examples----------


## internally defined function[＃内部定义的函数]
reader(ShortRead:::.fine_coverage)
viewer(ShortRead:::.fine_coverage)
limits(ShortRead:::.fine_coverage)

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