readBfaToc(ShortRead)
readBfaToc()所属R语言包:ShortRead
Get a list of the sequences in a Maq .bfa file
得到一个序列中的MAQ。博鳌亚洲论坛文件列表
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
As coverage needs to know the lengths of the reference sequences, this function is provided which extracts this information from a .bfa file (Maq's "binary FASTA" format).
coverage需要知道的参考序列的长度,这个功能是提供这个信息。博鳌亚洲论坛的文件(MAQ的“二元FASTA格式”格式)中提取。
用法----------Usage----------
readBfaToc( bfafile )
参数----------Arguments----------
参数:bfafile
The file name of the .bfa file.
的。BFA文件的文件名称。
值----------Value----------
An integer vector with one element per reference sequence found in the .bfa file, each vector element named with the
与参考序列。博鳌亚洲论坛文件中的每一个元素的整数向量,每个向量元素的命名
作者(S)----------Author(s)----------
Simon Anders, EMBL-EBI, <a href="mailto:sanders@fs.tum.de">sanders@fs.tum.de</a>
(Note: The C code for this function incorporates code from Li Heng's MAQ
software, (c) Li Heng and released by him under GPL 2.
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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