clean(ShortRead)
clean()所属R语言包:ShortRead
Remove sequences with ambiguous nucleotides from short read classes
从短期看类模棱两可的核苷酸序列
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Short reads may contain ambiguous base calls (i.e., IUPAC symbols different from A, T, G, C). This generic removes all sequences containing 1 or more ambiguous bases.
短读取可能包含歧义的基础呼叫(即不同的国际化联的A,T,G,C字符号)。这通用移除所有序列含有1个或多个暧昧碱基。
用法----------Usage----------
clean(object, ...)
参数----------Arguments----------
参数:object
An object for which clean methods exist; see below to discover these methods.
对象clean方法存在;见下面发现这些方法。
参数:...
Additional arguments, perhaps used by methods.
额外的参数,也许使用的方法。
Details
详情----------Details----------
The following method is defined, in addition to methods described in class-specific documentation:
下面的方法定义,除了类特定的文件中所描述的方法:
clean signature(x = "DNAStringSet"): Remove all sequences containing non-base (A, C, G, T) IUPAC
清理signature(x = "DNAStringSet"):删除所有序列含有非碱基(一,C,G,T),国际化联
值----------Value----------
An instance of class(object), containing only sequences with non-redundant nucleotides.
一个class(object)的实例,只与非冗余的核苷酸序列。
作者(S)----------Author(s)----------
Martin Morgan <mtmorgan@fhcrc.org>
举例----------Examples----------
showMethods('clean')
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注:
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