R语言 seqLogo包 pwm-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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pwm-class(seqLogo)
pwm-class()所属R语言包：seqLogo

                                        Class "pwm"
                                         类“PWM”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

An object of class "pwm" represents the 4xW position weight matrix of a DNA sequence motif. The entry in row i, column j gives the probability of observing nucleotide c("A","C","G","T")[i] in position j of the motif.  
"pwm"类的对象代表的DNA序列主题4xW位置权重矩阵。项中的第i行，第j列给出了观测核苷酸c("A","C","G","T")[i]的主题位置j的概率。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("pwm", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("pwm", ...)。


插槽----------Slots----------




consensus Object of class"character"
consensusObject类的"character"




ic Object of class "numeric"
icObject类的"numeric"




pwm Object of class "matrix" The position
pwm类"matrix"位置的对象




width: "numeric" The width of the motif.
width："numeric"图案的宽度。




alphabet: "character" The sequence
alphabet："character"序列


方法----------Methods----------




summary signature(object = "pwm",...) Prints the
摘要signature(object = "pwm",...)打印




print signature(x = "pwm",...) Prints the
打印signature(x = "pwm",...)打印




show signature(object = "pwm") Prints the
显示signature(object = "pwm")打印




plot signature(x = "pwm") Plots the
图signature(x = "pwm")图


作者（S）----------Author(s)----------


Oliver Bembom, <a href="mailto:bembom@berkeley.edu">bembom@berkeley.edu</a>

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。