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R语言 seqbias包 random.intervals()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 14:01:30 | 显示全部楼层 |阅读模式
random.intervals(seqbias)
random.intervals()所属R语言包:seqbias

                                        Generating random genomic intervals
                                         生成随机的基因组间隔

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a vector of sequence lengths, generate genomic intervals uniformly at
由于序列长度的向量,生成的基因组间隔均匀


用法----------Usage----------


random.intervals(I, n=1, ms=10000)



参数----------Arguments----------

参数:I
a GRanges object giving intervals from which to sample from
1农庄品尝从对象给予间隔


参数:n
number of intervals to generate
间隔数生成


参数:ms
length of the intervals to generate (may be a vector)
长度的时间间隔生成(可能是一个向量)


Details

详情----------Details----------

The function is used to place intervals of fixed sizes at random (possibly overlapping) positions across one or more sequences. The input should be a GRanges objects giving the sequence intervals in which the random intervals sholud be placed. If they are to be placed anywhere within a reference sequence, use the scanFaIndex function from Rsamtools, to obtain a set of intervals.
的功能是用来固定大小的时间间隔放置在一个或多个序列的随机(可能重叠)的立场。输入应该是一个GRanges对象给予序列在随机的时间间隔sholud放置的时间间隔。如果它们被放置在一个参考序列中的任何位置,从Rsamtools使用scanFaIndex函数,获得一组的间隔。


值----------Value----------

Returns a GRanges object giving the generated intervals.
返回一个农庄对象,使生成的时间间隔。


作者(S)----------Author(s)----------



Daniel Jones
<a href="mailto:dcjones@cs.washington.edu">dcjones@cs.washington.edu</a>




举例----------Examples----------


  library(Rsamtools)
  ref_fn <- system.file( "extra/example.fa", package = "seqbias" )
  ref_f <- FaFile( ref_fn )
  open.FaFile( ref_f )

  ref_seqs <- scanFaIndex( ref_f )

  I <- random.intervals( ref_seqs, n = 100, ms = 1000 )

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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