R语言 ScISI包 compareComplex()函数中文帮助文档(中英文对照)

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compareComplex(ScISI)
compareComplex()所属R语言包：ScISI

                                        A function to compare two bipartite graph matrices
                                         一个功能比较两个二分图矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The compareComplex function takes two bipartite graph matrix representations and calculates three statistics between all pairs of complexes, C-i and K-j: (1) the intersection between C-i and K-j, (2) the proteins in C-i and not in K-j, (3) the proteins in K-j and not in C-i. These stats are later used to calculate Jaccard and Dice-Sorenson Coefficients as well as probability distributions of a protein p in a complex C.
compareComplex函数有两个二分图矩阵表示，并计算出三者之间的配合，词和KJ所有对统计：（1）（2）词和KJ之间的交集，词中的蛋白质，而不是在KJ（ 3）在KJ，而不是在词的蛋白质。这些统计数据后用来计算Jaccard和骰子-索伦森系数的以及一个蛋白P的概率分布在一个复杂的C.


用法----------Usage----------


compareComplex(BGMat1, BGMat2)



参数----------Arguments----------

参数：BGMat1
The first bipartite graph matrix
第一个二分图矩阵


参数：BGMat2
The second bipartite graph matrix
第二个二分图矩阵


Details

详情----------Details----------

The main point to remember is that we don't compare complexes within the same matrix. We only compare pairs of complexes from the BGMat1 and BGMat2. The runCompareComplex function must be called first since all the labelled vertices present in BGMat1 must be present in the BGMat2 and vice versa so a true comparison can be made.
最主要的一点是要记住，我们不比较在同一矩阵的复合物。我们只比较，从BGMat1和BGMat2络合物对。 runCompareComplex函数必须首先调用，因为所有在BGMat1目前标记的顶点必须有这样一个真实的比较，可以在BGMat2反之亦然。


值----------Value----------

A list with the following entries:
以下条目列表：


参数：intersect
A matrix of pairwise intersections of the complexes of BGMat1 and BGMat2
一个成对路口的复合物的BGMat1和BGMat2矩阵


参数：cminusk
A matrix of the setdiff of the complexes of BGMat1 and those of BGMat2
一个的络合物BGMat1 setdiff的矩阵和BGMat2


参数：kminusc
A matric of the setdiff of the complexes of BGMat2 and those of BGMat1
一个的络合物BGMat2 setdiff的基质和BGMat1的


作者（S）----------Author(s)----------


Tony Chiang

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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