sage.library.comparison(sagenhaft)
sage.library.comparison()所属R语言包:sagenhaft
Class sage.library.comparison
类sage.library.comparison
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Class for storing the data of a pairwise comparison between two SAGE libraries.
类用于存储数据之间的两个SAGE文库的成对比较。
用法----------Usage----------
read.sage.library.comparison(file)
write.sage.library.comparison(x, file=paste(x$name, "sagecomp", sep="."))
compare.lib.pair(lib1, lib2)
参数----------Arguments----------
参数:x,lib1,lib2
A sage library object
一位哲人库对象
参数:file
File name to read or write to
文件名读取或写入到
Details
详情----------Details----------
SAGE library comparison objects consists of one data.frames. It stores a A and an M value which are the log2 average expression and log2 ratio, respectively. It also has a column for the resulting p.values from sage.test. read.sage.library.comparison and write.sage.library.comparison are utility functions to read and write SAGE library comparisons. compare.lib.pair can be used to generate SAGE library comparisons.
SAGE库中的比较对象包括一个data.frames。它存储一个M值log2平均表达的log2的比例,分别。它也有一个从sage.test导致p.values列。 read.sage.library.comparison和write.sage.library.comparison读写SAGE库比较的实用功能。 compare.lib.pair可以用来产生SAGE库比较。
作者(S)----------Author(s)----------
Tim Beissbarth
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3> <code>sage.test</code>
举例----------Examples----------
library(sagenhaft)
B6Hypo <- read.sage.library(system.file("extdata", "B6HypothalHFI.sage",
package="sagenhaft"))
E15post <- read.sage.library(system.file("extdata","E15postHFI.sage",
package="sagenhaft"))
libcomp <- compare.lib.pair(B6Hypo, E15post)
plot(libcomp)
libcomp
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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