UCSCSchema-class(rtracklayer)
UCSCSchema-class()所属R语言包:rtracklayer
UCSC Schema
UCSC的架构
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This is a preliminary class that describes a table in the UCSC database. The description includes the table name, corresponding genome, row count, and a textual description of the format. In the future, we could provide more table information, like the links and
这是一个初步的介绍了在UCSC数据库表的类。描述包括表名,相应的基因组,行数,以及文字描述的格式。在未来,我们可以提供更多的表的信息,如链接,
存取方法----------Accessor methods----------
In the code snippets below, x/object is a UCSCSchema object.
在下面的代码片段,x/object是UCSCSchema对象。
genome(x): Get the genome for the table.
genome(x):获取表的基因组。
tableName(x): Get the name of the table.
tableName(x):获取表的名称。
nrow(x): Get the number of rows in the table.
nrow(x):表中的行数。
formatDescription(x): Get a textual description of
formatDescription(x):获取的文字描述
作者(S)----------Author(s)----------
Michael Lawrence
举例----------Examples----------
## Not run: [#无法运行:]
session <- browserSession()
genome(session) <- "mm9"
query <- ucscTableQuery(session, "knownGene")
schema <- ucscSchema(query)
nrow(schema)
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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