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R语言 rtracklayer包 asBED()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 13:36:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
asBED(rtracklayer)
asBED()所属R语言包:rtracklayer

                                        Coerce to BED structure
                                         强迫到床结构

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Coerce the structure of an object to one following BED-like conventions, i.e., with columns for blocks and thick regions.
继床般公约,即列块厚的区域,强迫对象结构。


用法----------Usage----------


asBED(x, ...)
## S4 method for signature 'GRangesList'
asBED(x)



参数----------Arguments----------

参数:x
Generally, a tabular object to structure as BED  
一般来说,一个表格对象结构床上


参数:...
Arguments to pass to methods  
参数传递方法


Details

详情----------Details----------

The exact behavior depends on the class of object.
确切行为取决于类的object。




GRangesList This treats object as if it were a list of transcripts, i.e., each element contains the exons of a transcript. The blockStarts and blockSizes columns are derived from the ranges in each element. Also, add name column from names(object).
GRangesList这把object如果它是一个列表,即成绩单,每个元素包含外显子的成绩单。 blockStarts和blockSizes列从每个元素的范围的。此外,添加name从names(object)列。


值----------Value----------

A GRangesList like object, with the columns name, blockStarts and blockSizes added.
一个GRangesList喜欢列object,name,blockStarts和blockSizes补充。


作者(S)----------Author(s)----------



Michael Lawrence




举例----------Examples----------


## Not run: [#无法运行:]
library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene)
exons <- exonsBy(TxDb_Hsapiens_UCSC_hg19_knownGene)
values(asBED(exons))

## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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