asBED(rtracklayer)
asBED()所属R语言包:rtracklayer
Coerce to BED structure
强迫到床结构
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Coerce the structure of an object to one following BED-like conventions, i.e., with columns for blocks and thick regions.
继床般公约,即列块厚的区域,强迫对象结构。
用法----------Usage----------
asBED(x, ...)
## S4 method for signature 'GRangesList'
asBED(x)
参数----------Arguments----------
参数:x
Generally, a tabular object to structure as BED
一般来说,一个表格对象结构床上
参数:...
Arguments to pass to methods
参数传递方法
Details
详情----------Details----------
The exact behavior depends on the class of object.
确切行为取决于类的object。
GRangesList This treats object as if it were a list of transcripts, i.e., each element contains the exons of a transcript. The blockStarts and blockSizes columns are derived from the ranges in each element. Also, add name column from names(object).
GRangesList这把object如果它是一个列表,即成绩单,每个元素包含外显子的成绩单。 blockStarts和blockSizes列从每个元素的范围的。此外,添加name从names(object)列。
值----------Value----------
A GRangesList like object, with the columns name, blockStarts and blockSizes added.
一个GRangesList喜欢列object,name,blockStarts和blockSizes补充。
作者(S)----------Author(s)----------
Michael Lawrence
举例----------Examples----------
## Not run: [#无法运行:]
library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene)
exons <- exonsBy(TxDb_Hsapiens_UCSC_hg19_knownGene)
values(asBED(exons))
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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