R语言 RTopper包 RTopper-package()函数中文帮助文档(中英文对照)

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RTopper-package(RTopper)
RTopper-package()所属R语言包：RTopper

                                         A package to perform run Gene Set Enrichment across genomic platforms
                                         一个包来执行整个基因组平台上运行基因集富集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Gene sets analysis considers whether genes sharing a biological property also behave in a related way in experimental data. This technique is commonly used in high throughput genomic analyses to assist results interpretation, and has been successfully applied in cancer genome projects for integrating information from multiple genome-wide assays. The RTopper package uses gene sets analysis to overcome the diversity of genomic data providing the statistical framework for integration across data types.
基因集分析认为，共用一个生物属性的基因是否也表现在相关实验数据的方式。这种技术通常用于高通量的基因组分析，以协助解释结果，并已成功地应用于癌症基因组项目，整合来自多个全基因组分析的信息。 RTopper包使用基因集分析，以克服基因组数据提供的统计数据类型之间的整合框架的多样性。


Details

详情----------Details----------


RTopper包功能----------RTopper package features----------

Rtopper enables two gene set-based data integration approaches:
Rtopper使两个基因组为基础的数据集成方法：




1  Integration+GSA: computing integrated gene-to-phenotype
1整合+ GSA：计算综合基因表型




2  GSA+Integration: computing consensus significance score
2 GSA的整合：计算共识意义得分




3  Use of alternative enrichment test: RTopper uses the Wilcoxon rank-sum test for enrichment testing, however
3使用替代浓缩试验：RTopper使用浓缩测试Wilcoxon秩和检验，但是




4  Multiple testing correction: RTopper enables
4多个测试校正：RTopper使


作者（S）----------Author(s)----------



Luigi Marchionni <a href="mailto:marchion@jhu.edu">marchion@jhu.edu</a>




参考文献----------References----------

"Integrating diverse genomic data using gene sets." Manuscript submitted.
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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