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R语言 RTools4TB包 getTBInfo()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 13:34:20 | 显示全部楼层 |阅读模式
getTBInfo(RTools4TB)
getTBInfo()所属R语言包:RTools4TB

                                        Get information about an experiment or a platform.
                                         大约一个实验平台,获取信息。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function fetch informations from the TBrowserDB for a microarray experiment, a microarray platform or a transcriptional signature.
此功能TBrowserDB微阵列实验,一个芯片平台或转录签名获取信息。


用法----------Usage----------


getTBInfo(field = c("platform", "experiment", "signature", "samples"), value = NULL, verbose = TRUE, save = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:field
The type of information to retrieve. Should be one of "platform", "experiment" or "signature".
检索的信息类型。应该是一个“平台”,“实验”或“签名”。


参数:value
A platform ID (e.g., GPL96), experiment ID (e.g., GSE2004) or signatureID (e.g., "0AC1A39A5") depending on the "field" argument.
一个平台ID(,GPL96),实验ID(例如,GSE2004)或signatureID(例如,“0AC1A39A5”)根据“场”的说法。


参数:verbose
If set to TRUE the fonction displays informations on the screen.
如果设置为TRUE fonction显示在屏幕上的信息。


参数:save
if set to TRUE data are stored onto disk.  
如果设置为TRUE,数据存储到磁盘。


值----------Value----------

The output will differ depending one the field argument.
输出会有所不同,这取决于一个field参数。


参数:
if field = "platform", the function will display plateform informations (e.g.: name, organism, manufacturer, nb. probes, nb. genes, Title and Description).
如果field = "platform",该函数将显示平板的信息(如:名称,生物,制造商,NB探针,NB基因,标题和描述)。


参数:
if field = "experiment", the function will display informations about the experiment (e.g.: name, organism, PMID, nb. samples, title and summary).
如果field = "experiment",功能将有关实验显示的信息(如:名称,生物,单元,NB样品,标题和摘要。)。


参数:
if field = "signature", the function will display informations about the experiment (e.g.: signatureID, platform, experiment, organism, nb.probes, nb.genes, nb.samples).
如果field = "signature",函数将显示有关实验(例如:signatureID平台,实验,生物,nb.probes,nb.genes,nb.samples的)信息。


参数:
if field = "samples", the function will display informations about all the samples from an signatureID (e.g.: sampleID, descriptions).
如果field = "samples",该函数将显示从signatureID(如:sampleID,描述)对所有样品的信息。


作者(S)----------Author(s)----------


Bergon A., Lopez F., Textoris J., Granjeaud S. and Puthier D.



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

Other function which allow to query the TBrowser database: getSignatures, getExpressionMatrix
其他功能,允许查询的TBrowser数据库:getSignatures,getExpressionMatrix


举例----------Examples----------


## Not run: [#无法运行:]
# retrieving information related to GSE2004[检索信息涉及到GSE2004]
gse2004Info <- getTBInfo(field="experiment", value="GSE2004")

# retrieving information related to GPL96[检索信息涉及到GPL96]
gpl96Info <- getTBInfo(field="platform", value="GPL96")

# retrieving information related to a signature[有关签名的检索信息]
signInfo <- getTBInfo(field="signature", value="0AC1A39A5")

# retrieving samples information related to a signature[检索样品信息与签名]
samplesInfo <- getTBInfo(field="samples", value="0AC1A39A5")

## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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