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R语言 rqubic包 features-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 13:26:52 | 显示全部楼层 |阅读模式
features-methods(rqubic)
features-methods()所属R语言包:rqubic

                                         Extract features and conditions
                                         提取特征和条件

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generic function features and conditions, as well as auxillary count functions, are implemented for QUBICBiclusterSet objects.
泛型函数features和conditions,以及辅助的计数功能,实现QUBICBiclusterSet对象。

They can be used in one of the following forms:
它们可用于下列形式之一:

Used on a QUBICBiclusterSet, and without specifying index, features or conditions returns the unique and ordered features or conditions involved in at least one bicluster, and featureCount or conditionCount returns the length of repsective vectors. To get the feature/condition numbers in each bicluster of the set, use BCfeatureCount/BCconditionCount.
QUBICBiclusterSet,使用和不指定指数,features或conditions返回独特的有序参与功能或至少在一个bicluster条件,featureCount或<X >返回repsective向量的长度。为了获得在功能/条件数每个集bicluster的,使用conditionCount/BCfeatureCount。

Used on a QUBICBiclusterSet and provided index (indices), the features/conditions or their counts are returned for specified biclusters.
特性/条件或他们的罪名是使用1 QUBICBiclusterSet“提供的指数(指数),返回指定biclusters的。

In addition, featureNames and sampleNames are of the same implementation as features and conditions.
此外,featureNames和sampleNames的features和conditions相同的实现。


方法----------Methods----------

Information about all the biclusters.
信息的biclusters。

Information about all the biclusters in the set.
信息集biclusters。

Information about selected biclusters in the set, the index can be integers or logical variables for subsetting.
约集选择biclusters信息,该指数可以是整数或逻辑变量子集。


作者(S)----------Author(s)----------



Jitao David Zhang &lt;jitao_david.zhang@roche.com&gt;




参考文献----------References----------

(2009) QUBIC: a qualitative biclustering algorithm for analyses of gene expression data. Nucleic Acids Research, 37:e101

参见----------See Also----------

Methods are also documented in QUBICBiclusterSet.
方法也记录在QUBICBiclusterSet。


举例----------Examples----------


example.file <- system.file("extdata", "sampleExpressionSet.blocks", package="rqubic")

example.block <- parseQubicBlocks(example.file)

head(features(example.block))
featureCount(example.block)
head(conditions(example.block))
conditionCount(example.block)

BCfeatureCount(example.block)
BCfeatures(example.block)[1:2]
BCconditionCount(example.block)
BCconditions(example.block)[1:2]

head(featureNames(example.block))
head(sampleNames(example.block))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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