R语言 RpsiXML包 psimi25Source-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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psimi25Source-class(RpsiXML)
psimi25Source-class()所属R语言包：RpsiXML

                                        Class "psimi25Source"
                                         类“psimi25Source”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A class representing data source compatible with PSI-MI
A类代表与PSI  -  MI兼容的数据源


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("psimi25Source", ...)
对象可以创建检测的形式new("psimi25Source", ...)


插槽----------Slots----------




label: Object of class "character", a meaningful unique label of the database, does not necessarily have to be the identifier used in the PSI-MI files. The value is advised to
label：Object类的"character"，数据库中的唯一一个有意义的标签，并不一定是在PSI-MI的文件中使用的标识符。建议值




sourceDb: Object of class "character", the character string used in the PSI-MI files to identify the source database. The value must be overwritten by the object, depending
sourceDb：Object类的"character"，在PSI-MI的文件用于识别源数据库的字符串。该值必须覆盖对象，这取决于




uniprotSymbol: Object of class "character", the identifier of UniProf reference in "primaryRef" or "secondaryRef" attributes of the interactors, telling the parser where to find UniProt symbol of the interactors. The value must be overwritten by
uniprotSymbol：Object类的"character"，UniProf引用告诉解析器在哪里可以找到UniProt团团员的象征，在“primaryRef”或的“secondaryRef”的团团员的属性标识符。该值必须被改写


方法----------Methods----------




sourceDb signature(x = "psimi25Source"): returns the
sourceDbsignature(x = "psimi25Source")：返回




uniprot signature(x = "psimi25Source"): returns the
uniprotsignature(x = "psimi25Source")：返回


注意----------Note----------

In case of a new data repository, you can first try creating a new object of the class with label, sourceDb and uniprotSymbol adjusted as needed. Try parsing a function with this new psimi25Source object. In case of warnings or errors, it may mean that the file provided is not strictly compatible with PSI-MI 2.5 data exchange format standard, please then contact the data provider.
在一个新的数据仓库的情况下，你可以先试试label，sourceDb和uniprotSymbol调整需要的类创建一个新对象。尝试解析与这个新psimi25Source对象的函数。在警告或错误的情况下，它可能意味着提供的文件是不严格的PSI-MI 2.5数据交换格式标准兼容，那么请联系数据提供商。


作者（S）----------Author(s)----------


Jitao David Zhang <jitao_david.zhang@roche.com>



参见----------See Also----------

parsePsimi25Interaction, parsePsimi25Complex, psimi25XML2Graph
parsePsimi25Interaction，parsePsimi25Complex，psimi25XML2Graph


举例----------Examples----------


showClass("psimi25Source")

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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