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R语言 RpsiXML包 interactorInfo()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 13:23:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
interactorInfo(RpsiXML)
interactorInfo()所属R语言包:RpsiXML

                                         Interactor info in a matrix
                                         在矩阵interactor信息

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function returns the essential information of interactors in a matrix. Xrefs are left out since they have arbitrary numbers of annotation and cannot be summarized into a matrix.
该函数返回一个矩阵团团员基本信息。外部参照冷落,因为他们有任意数量的注释,并不能概括成一个矩阵。


用法----------Usage----------


interactorInfo(x)



参数----------Arguments----------

参数:x
An object which contains psimi25Interactor information, for example objects of psimi25InteractionEntry-class, psimi25Graph-class, psimi25Hypergraph-class or psimi25ComplexEntry-class  </table>
一个对象其中包含psimi25Interactor信息,psimi25InteractionEntry-class,psimi25Graph-class,psimi25Hypergraph-class或psimi25ComplexEntry-class</表>例如对象


值----------Value----------

A matrix of interactor information, each row represents an interactor The columns are
一个interactor信息矩阵,每一行代表一个interactor列


参数:sourceDb
source database
源数据库


参数:sourceId
source database index
源数据库索引


参数:shortLabel
short label assigned by the source database
源数据库分配的短标签


参数:uniprotId
UniProt ID, NA if not available
UniProt编号,NA如果没有可用


参数:organismName
the organism of the interactor protein
的interactor蛋白的有机体


作者(S)----------Author(s)----------


Jitao David Zhang &lt;jitao_david.zhang@roche.com&gt;



参见----------See Also----------

xref, availableXrefs
xref,availableXrefs


举例----------Examples----------


xmlDir <- system.file("/extdata/psi25files",package="RpsiXML")

hprdxml <- file.path(xmlDir, "hprd_200709_test.xml")
hprdSet <- parsePsimi25Interaction(hprdxml, HPRD.PSIMI25)

hprdInteractorInfo <- interactorInfo(hprdSet)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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