rpa.plot(RPA)
rpa.plot()所属R语言包：RPA
Plot RPA results and probe-level data for a specified probeset.
图爱国结果和指定probeset的探针级数据。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plots the preprocessed probe-level observations, estimated probeset-level signal, and probe-specific variances. It is also
图预处理探针级的意见，估计probeset级信号，探针的具体差异。这也是
用法----------Usage----------
"darkgrey", mucol = "black", ecol = "red", cex.lab = 1.5, cex.axis = 1, cex.main = 1, cex.names = 1, external.signal = NULL, main = "", plots = "all", ...)
参数----------Arguments----------
参数：dat
Original data: probes x samples.
原始数据：探针x样品。
参数：rpa.fit.object
An instance of the 'rpa.fit' class.
“rpa.fit”类的一个实例。
参数：toydata.object
Optional. Output from sample.probeset toydata generator function. Can be used to compare (toy)data with known ground truth to RPA estimates from rpa.fit.object.
可选的。从sample.probeset toydata发生器功能的输出。可以用来比较（玩具）的数据与已知的地面真相从rpa.fit.object爱国估计。
参数：highlight.probes
Optionally highlight some of the probes (with dashed line)
可选突出一些探针（虚线）
参数：pcol
Color for probe signal visualization.
为探针的信号可视化的色彩。
参数：mucol
Color for summary estimate.
摘要估计的颜色。
参数：ecol
Color for external signal.
外部信号的颜色。
参数：cex.lab, cex.axis, cex.main, cex.names
Font size adjustment parameters.
字体大小调整参数。
参数：external.signal
Plot external signal on the probeset. For instance, an alternative summary estimate from another preprocessing methods
绘制的probeset上的外部信号。例如，从另一个预处理方法替代汇总预算
参数：main
Title text.
标题文本。
参数：plots
"all": plot data and summary, noise and affinity "data": plot data and summary
“所有”：小区数据和总结，噪音和亲和力的“数据”：图的数据和总结
参数：...
Other parameters to pass for plot function.
其他参数传递给绘图功能。
值----------Value----------
Used for its side-effects. Returns probes x samples matrix of
用于其副作用。返回探针x样品基质
作者（S）----------Author(s)----------
Leo Lahti <a href="mailto:leo.lahti@iki.fi">leo.lahti@iki.fi</a>
参考文献----------References----------
Gene Expression Studies with Short Oligonucleotide Arrays. Lahti et
参见----------See Also----------
RPA.pointestimate
RPA.pointestimate
举例----------Examples----------
# Not run:[不运行：]
## Load example data set[＃加载示例数据集]
#require(affydata)[要求（affydata）]
#data(Dilution)[数据（稀释）]
## Compute RPA for specific probesets only [仅＃计算特定probesets爱国]
#set <- "1000_at"[集< - “1000_at”]
#rpa.results <- RPA.pointestimate(Dilution, set)[rpa.results < - RPA.pointestimate（稀释，集）]
## Visualize the results for one of the probe sets[＃探针集可视化的结果]
#rpa.plot(set, rpa.results)[rpa.plot（套，rpa.results）]
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注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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发表于 2012-2-26 13:21:27
