R语言 RPA包 rpa.list-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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rpa.list-class(RPA)
rpa.list-class()所属R语言包：RPA

                                        Class "rpa.list"
                                         类“rpa.list”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Class for the RPA package.
RPA的包类。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("rpa.list", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("rpa.list", ...)。


插槽----------Slots----------

An extended list. Contains the following information for one probeset.
扩展列表。包含一个probeset的的以下信息。




.Data: Object of class "list"
.Data类"list"：对象




d  A vector (probeset x arrays). Specifies the estimated 'true' underlying differential gene expression signal over the arrays (vs. the reference array 'cind') for the investigated probeset. Note that the reference array is not
D A向量（probeset x阵列）。指定估计真正的“基础差以上的调查probeset阵列（与参考阵列”cind）基因表达的信号。请注意，参考阵列是不




mu.real  Deviation between the signal shape and the real signal level. Here d is the sum of mu.real and shape; affinities are calculated around d = mu.real + shape. Note that in Lahti11 paper d denotes the shape; we will polish the notation later.
mu.real信号的形状和真正的信号电平之间的偏差。在这里，d是的mu.real和形状的总和;亲和力计算D = mu.real +形状周围。注意，d表示在Lahti11纸的形状，我们将打磨后的符号。




sigma2  Contains a vector that gives the estimated variance
sigma2包含一个向量，使估计方差




affinity A list. Each element corresponds to a probeset, and contains a vector that gives the estimated affinity effect for each probe in that
亲和力列表。每个元素对应一个probeset的，包含一个矢量估计的亲和力效果，使每个探针




cind  Specifies which of the arrays in abatch was used as the reference for computing probe-level differential
cind指定哪些在abatch阵列被用于计算探针水平差的参考




set  Probeset name.
设置Probeset名称。




data  Preprocessed probe-level data on which the model was
数据预处理探针级数据模型


延伸----------Extends----------

Class "list", from data part. Class "vector", by class "list", distance 2.
类"list"，从数据的一部分。类"vector"，由类“列表”，距离为2。


方法----------Methods----------




plot signature(x = "rpa.list"): ...
图signature(x = "rpa.list")：...


作者（S）----------Author(s)----------


Leo Lahti <a href="mailto:leo.lahti@iki.fi">leo.lahti@iki.fi</a>



参考文献----------References----------

Gene Expression Studies with Short Oligonucleotide Arrays.  Lahti et

举例----------Examples----------



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注：
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