R语言 RPA包 plot()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plot(RPA)
plot()所属R语言包：RPA

                                        Plot RPA results and probe-level data for a specific probeset.
                                         图爱国结果和特定probeset的探针级数据。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots the preprocessed probe-level observations, estimated probeset-level signal, and probe-specific variances. It is also
图预处理探针级的意见，估计probeset级信号，探针的具体差异。这也是


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：x,y
Instances of the 'rpa class; y is optional and never used. Provided for consistency.
“爱国类的实例; y是可选的，从来没有使用过。提供的一致性。


参数：set
Probeset to plot.
Probeset绘图。


参数：highlight.probes
Optionally highlight some of the probes (with dashed line)
可选突出一些探针（虚线）


参数：pcol
Color for probe signal visualization.
为探针的信号可视化的色彩。


参数：mucol
Color for summary estimate.
摘要估计的颜色。


参数：ecol
Color for external signal.   
外部信号的颜色。


参数：cex.lab, cex.axis, cex.names, cex.main
Axis adjustment parameters.
轴调整参数。


参数：external.signal
Plot external signal on the probeset. For instance, an alternative summary estimate from another preprocessing methods.
绘制的probeset上的外部信号。例如，从另一个预处理方法的替代总结估计。


参数：main
Title for plot.
对于图的标题。


参数：plots
Type of plot. See help(rpa.plot).
图类型。请参阅帮助（rpa.plot）。


参数：...
Other arguments to be passed.
其他参数予以通过。


值----------Value----------

Used for side-effects. Returns probes x samples matrix of
用于副作用。返回探针x样品基质


作者（S）----------Author(s)----------


Leo Lahti <a href="mailto:leo.lahti@iki.fi">leo.lahti@iki.fi</a>



参考文献----------References----------

Gene Expression Studies with Short Oligonucleotide Arrays.  Lahti et

参见----------See Also----------

RPA.pointestimate
RPA.pointestimate


举例----------Examples----------



# Not run:[不运行：]

## Load example data set[＃加载示例数据集]
#require(affydata)[要求（affydata）]
#data(Dilution)[数据（稀释）]

## Compute RPA for specific probesets only        [仅＃计算特定probesets爱国]
#set &lt;- "1000_at"[集< - “1000_at”]
#rpa.results &lt;- RPA.pointestimate(Dilution, set)[rpa.results < -  RPA.pointestimate（稀释，集）]

## Visualize the results for one of the probe sets[＃探针集可视化的结果]
#plot(rpa.results, set)[图（rpa.results，集）]


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